RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429374.5

HDAC10-204, Transcript of histone deacetylase 10, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HDAC10, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10-204ENST00000429374 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.06■■□□□ 1.12
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HDAC10-204ENST00000429374 TEKT1Q969V4 418 aa22.06■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 ECE2O60344 883 aa22.06■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 TRIM29Q14134 588 aa22.06■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 PSMD1Q99460 953 aa22.06■■□□□ 1.12
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HDAC10-204ENST00000429374 USP17L4A6NCW7 530 aa22.05■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 TFAP4Q01664 338 aa22.05■■□□□ 1.12
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HDAC10-204ENST00000429374 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.05■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.05■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 PHKBQ93100 1093 aa22.05■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.05■■□□□ 1.12
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HDAC10-204ENST00000429374 CCDC93Q567U6 631 aa22.04■■□□□ 1.12
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HDAC10-204ENST00000429374 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.04■■□□□ 1.12
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HDAC10-204ENST00000429374 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.04■■□□□ 1.12
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HDAC10-204ENST00000429374 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.04■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.04■■□□□ 1.12
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HDAC10-204ENST00000429374 SOGA3Q5TF21 947 aa22.03■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 KRT40Q6A162 431 aa22.03■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.03■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.03■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.02■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 RASA1P20936 1047 aa22.02■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 CDK8P49336 464 aa22.02■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 TGFB2P61812 414 aa22.02■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.02■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.02■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 SCN9AQ15858 1988 aa22.02■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.02■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 YEATS4O95619 227 aa22.02■■□□□ 1.11
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HDAC10-204ENST00000429374 FUT2Q10981 343 aa22.02■■□□□ 1.11
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HDAC10-204ENST00000429374 PPFIA3O75145 1194 aa22.01■■□□□ 1.11
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HDAC10-204ENST00000429374 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.01■■□□□ 1.11
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HDAC10-204ENST00000429374 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.01■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 XBP1P17861 261 aa22■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 USP28Q96RU2 1077 aa22■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 KAT14Q9H8E8 782 aa22■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 SWAP70Q9UH65 585 aa22■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.99■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 C21orf2O43822 256 aa21.99■■□□□ 1.11
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HDAC10-204ENST00000429374 GABPAQ06546 454 aa21.99■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 AOC3Q16853 763 aa21.99■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.99■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.99■■□□□ 1.11
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HDAC10-204ENST00000429374 PGBD1Q96JS3 809 aa21.98■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 AIFM3Q96NN9 605 aa21.98■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 PPIP5K2O43314 1243 aa21.98■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 NMT2O60551 498 aa21.98■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 DPEP1P16444 411 aa21.98■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.98■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 IDI2Q9BXS1 227 aa21.98■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 SYCE3A1L190 88 aa21.97■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.97■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 PNMA1Q8ND90 353 aa21.97■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 MXD3Q9BW11 206 aa21.97■■□□□ 1.11
HDAC10-204ENST00000429374 MTFR1LQ9H019 292 aa21.97■■□□□ 1.11
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