RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 CFAP100Q494V2 611 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 SHTN1A0MZ66 631 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 POTECB2RU33 542 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 DLGAP5Q15398 846 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 ZSCAN26Q16670 478 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 APPBP2Q92624 585 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 WDR90Q96KV7 1748 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 MYH2Q9UKX2 1941 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 BAG3O95817 575 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 PPP4CP60510 307 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 CCDC181Q5TID7 509 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 ADGRA1Q86SQ6 560 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 HELLSQ9NRZ9 838 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 MYH7P12883 1935 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 AK9Q5TCS8 1911 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 SPDYE2BA6NHP3 402 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 CHGBP05060 677 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 SPDYE6P0CI01 402 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 CHMLP26374 656 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 SLFNL1Q499Z3 407 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 SCN4AP35499 1836 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 WNT10BO00744 389 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 EPHX2P34913 555 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 BTDP43251 543 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 TERF2Q15554 542 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 OSBP2Q969R2 916 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 MAST2Q6P0Q8 1798 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 MYO1BO43795 1136 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 CDC45O75419 566 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 EGFRP00533 1210 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 PLCG2P16885 1265 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 MUM1L1Q5H9M0 696 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 RUFY2Q8WXA3 655 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 UBA5Q9GZZ9 404 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 RRAGCQ9HB90 399 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 CCT2P78371 535 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 MIGA1Q8NAN2 632 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 AIDAQ96BJ3 306 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 FAM227BQ96M60 508 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 RHBDL3P58872 404 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 LONRF3Q496Y0 759 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 ATL2Q8NHH9 583 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 USP40Q9NVE5 1235 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 JRKLQ9Y4A0 524 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 A0A0D9SFI3 127 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 ATP2B1P20020 1258 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 MAP9Q49MG5 647 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 NMRK2Q9NPI5 230 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 M0R2C6 588 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 GPAA1O43292 621 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 PPFIA2O75334 1257 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 MBD4O95243 580 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 YY1P25490 414 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 SYCP1Q15431 976 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 FKBP1CQ5VVH2 108 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-201ENST00000351328 IDI2Q9BXS1 227 aa8.1□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms