RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000224016.1

Ap3m1-208, Transcript of AP-3 complex subunit mu-1, mouse

BASIC

Gene Ap3m1, Length 764 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Klhl33	G3UW92	533 aa		6.62	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Tnfrsf1b	P25119	474 aa		6.62	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Gja5	Q01231	358 aa		6.62	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Eif2ak2	Q03963	515 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Pcdhga7	Q6DD96	935 aa		6.62	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Pcdhb14	Q6PB90	796 aa		6.62	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Jade1	Q6ZPI0	834 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Cdpf1	Q8R3A2	119 aa		6.62	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ubxn2a	Q99KJ0	258 aa		6.62	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Tktl2	Q9D4D4	627 aa		6.62	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Fmnl1	Q9JL26	1094 aa		6.62	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Adam17	Q9Z0F8	827 aa		6.62	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Kndc1	Q0KK55	1742 aa		6.62	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Lzts3	A2AHG0	700 aa		6.61	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Tbx3	P70324	741 aa		6.61	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Tmem40	Q4FJU9	225 aa		6.61	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Lpo	Q5SW46	710 aa		6.61	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Engase	Q8BX80	734 aa		6.61	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Glis2	Q8VDL9	521 aa		6.61	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ttc5	Q99LG4	440 aa		6.61	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016		A0A1Y7VJ07	166 aa		6.6	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	A030014E15Rik	A0A1Y7VJV2	120 aa		6.6	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Pnisr	A2AJT4	805 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Gm4985	A2ALC6	410 aa		6.6	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Usp17ld	G5E8G2	545 aa		6.6	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Usp17lc	G5E8I7	545 aa		6.6	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Dhx15	O35286	795 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Lrch1	P62046	709 aa		6.6	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Treml4	Q3LRV9	263 aa		6.6	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Srbd1	Q497V5	1015 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Gsdma3	Q5Y4Y6	464 aa		6.6	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Slco4c1	Q8BGD4	722 aa		6.6	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Pcmtd2	Q8BHD8	359 aa		6.6	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Slfnl1	Q8BHW9	410 aa		6.6	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Dars2	Q8BIP0	653 aa		6.6	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Slc9a9	Q8BZ00	644 aa		6.6	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Mpst	Q99J99	297 aa		6.6	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Dll4	Q9JI71	686 aa		6.6	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Mkrn1	Q9QXP6	481 aa		6.6	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Mical3	Q8CJ19	1993 aa		6.6	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Flt1	P35969	1333 aa		6.59	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Fignl2	J3QK54	644 aa		6.59	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Tert	O70372	1122 aa		6.59	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Eif4a2	P10630	407 aa		6.59	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Epha1	Q60750	977 aa		6.59	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ager	Q62151	402 aa		6.59	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Trim6	Q8BGE7	488 aa		6.59	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Akr7a2	Q8CG76	367 aa		6.59	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Foxp3	Q99JB6	429 aa		6.59	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Bcs1l	Q9CZP5	418 aa		6.59	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Rtp4	Q9ER80	249 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Orc1	Q9Z1N2	840 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Afdn	Q9QZQ1	1820 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Scn11a	Q9R053	1765 aa		6.59	□□□□□ -1.35
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Scn9a	Q62205	1984 aa		6.58	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Sec14l1	A8Y5H7	715 aa		6.58	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Dcdc2b	F7BCK0	340 aa		6.58	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Gsg1l2	M0QWL6	290 aa		6.58	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Nfatc3	P97305	1075 aa		6.58	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Cdcp1	Q5U462	833 aa		6.58	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Foxn1	Q61575	648 aa		6.58	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Vil1	Q62468	827 aa		6.58	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Iffo2	Q8R2V2	512 aa		6.58	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Mrpl50	Q8VDT9	159 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	St5	Q924W7	1134 aa		6.58	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Efcc1	Q9JJF6	558 aa		6.58	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ncor1	Q60974	2453 aa		6.57	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Pappa2	E9PZ87	1789 aa		6.57	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Larp1b	A0A0A6YXJ7	370 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ldlrad1	D3YYZ1	218 aa		6.57	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Pwwp2b	E9Q9M8	600 aa		6.57	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Mansc4	Q3UU94	337 aa		6.57	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Gm14851	Q5ERJ0	116 aa		6.57	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Proser1	Q5PRE5	913 aa		6.57	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Tctn1	Q8BZ64	593 aa		6.57	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Shisa4	Q8CA71	197 aa		6.57	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Cog6	Q8R3I3	657 aa		6.57	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Zbtb1	Q91VL9	713 aa		6.57	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Dpp7	Q9ET22	506 aa		6.57	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Dpf1	Q9QX66	387 aa		6.57	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Nav1	Q8CH77	1875 aa		6.57	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Spef2	Q8C9J3	1734 aa		6.56	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Gm42688	A0A0R3P9D1	673 aa		6.56	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Kprp	B2RUR4	657 aa		6.56	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Map2k1	P31938	393 aa		6.56	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Nub1	P54729	614 aa		6.56	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Strn4	P58404	760 aa		6.56	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Irx3	P81067	507 aa		6.56	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ccdc142	Q8CAI1	738 aa		6.56	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Unc5b	Q8K1S3	945 aa		6.56	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Olfr127	Q8VF25	323 aa		6.56	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Tm4sf4	Q91XD3	202 aa		6.56	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Efcab2	Q9CQ46	164 aa		6.56	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Hypk	Q9CR41	129 aa		6.56	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Amotl1	Q9D4H4	968 aa		6.56	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Dclk1	Q9JLM8	756 aa		6.56	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ptf1a	Q9QX98	324 aa		6.56	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Efcab12	V9GXH0	673 aa		6.56	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Met	P16056	1379 aa		6.56	□□□□□ -1.36
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Syde2	E9PUP1	1314 aa		6.55	□□□□□ -1.36

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.1 ms