RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000185355.6

Ldb1-208, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 2,088 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Igsf9b	E9PZ19	1328 aa		31.88	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Acad12	D3Z7X0	555 aa		31.88	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	DSCC1	Q14AI0	399 aa		31.88	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Luc7l2	Q7TNC4	392 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Vps53	Q8CCB4	832 aa		31.88	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gimap7	Q8R379	293 aa		31.88	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Uba5	Q8VE47	403 aa		31.88	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Usp13	Q5BKP2	858 aa		31.87	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lrmp	Q60664	539 aa		31.87	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Triml1	Q8BVP1	470 aa		31.87	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rbm10	Q99KG3	930 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lmbr1	Q9JIT0	490 aa		31.87	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Irx4	Q9QY61	515 aa		31.87	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Atp12a	Q9Z1W8	1035 aa		31.87	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Chd5	A2A8L1	1946 aa		31.87	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dhx8	A2A4P0	1244 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gm3893	E9Q1I1	302 aa		31.87	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tlr8	P58682	1032 aa		31.87	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ift122	Q6NWV3	1182 aa		31.87	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nup133	Q8R0G9	1155 aa		31.87	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Iqca1	Q9CUL5	857 aa		31.87	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Polr2d	Q9D7M8	142 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lamb1	P02469	1786 aa		31.86	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tpm3-rs7	D3Z2H9	248 aa		31.86	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Peak1	Q69Z38	1735 aa		31.86	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ube2o	Q6ZPJ3	1288 aa		31.86	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dlat	Q8BMF4	642 aa		31.86	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nek3	Q9R0A5	511 aa		31.86	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Myl3	P09542	204 aa		31.85	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ftl1	P29391	183 aa		31.85	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rad23b	P54728	416 aa		31.85	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kiaa1468	Q148V7	1216 aa		31.85	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ankrd13d	Q6PD24	605 aa		31.85	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Arid5b	Q8BM75	1188 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccdc94	Q9D6J3	314 aa		31.85	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ythdc1	E9Q5K9	736 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Phldb3	E9QAF4	648 aa		31.85	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nap1l2	P51860	460 aa		31.85	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Galc	P54818	684 aa		31.85	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fxr1	Q61584	677 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tas2r124	Q7M718	309 aa		31.85	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Csrnp2	Q8BGQ2	534 aa		31.85	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lrrd1	Q8C0R9	853 aa		31.85	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ano3	A2AHL1	981 aa		31.84	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nbr1	P97432	988 aa		31.84	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ppp4c	P97470	307 aa		31.84	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Plekha7	Q3UIL6	1118 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hexim1	Q8R409	356 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Plekhg2	Q6KAU7	1340 aa		31.84	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cyp26c1	B2RXA7	518 aa		31.84	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ctdspl2	Q8BG15	465 aa		31.84	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Larp6	Q8BN59	492 aa		31.84	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Uvssa	Q9D479	717 aa		31.84	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gda	Q9R111	454 aa		31.84	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	1700013D24Rik	Q0P521	120 aa		31.83	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Psd3	Q2PFD7	1037 aa		31.83	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tekt3	Q6X6Z7	490 aa		31.83	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	St5	Q924W7	1134 aa		31.83	■■■□□ 2.69
Ldb1-208	ENSMUST00000185355		A0A1L1SQF0	893 aa		31.82	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Stx8	O88983	236 aa		31.82	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Scg2	Q03517	617 aa		31.82	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mycbpap	Q5SUV2	932 aa		31.82	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Radx	Q8C779	850 aa		31.82	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Trmt44	Q9D2Q2	713 aa		31.82	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Calml3	Q9D6P8	149 aa		31.82	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gpaa1	Q9WTK3	621 aa		31.82	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pfkfb3	A7UAK5	555 aa		31.82	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gm10134	F6ZQC6	126 aa		31.82	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Anks1a	P59672	1150 aa		31.82	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nyap1	Q6PFX7	833 aa		31.82	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Stn1	Q8K2X3	378 aa		31.82	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rpusd2	Q149F1	553 aa		31.81	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gtf2f1	Q3THK3	508 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Psd	Q5DTT2	1024 aa		31.81	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tubgcp2	Q921G8	905 aa		31.81	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Vps16	Q920Q4	839 aa		31.8	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pnn	O35691	725 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Znf667	Q2TL60	609 aa		31.8	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pex1	Q5BL07	1284 aa		31.8	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ndufb9	Q9CQJ8	179 aa		31.79	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ly75	Q60767	1723 aa		31.79	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gm36210	A0A1B0GS00	229 aa		31.79	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gm5624	F6ZZG8	207 aa		31.79	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Trim30a	P15533	496 aa		31.79	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kcnd1	Q03719	651 aa		31.79	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Trappc10	Q3TLI0	1259 aa		31.79	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccp110	Q7TSH4	1004 aa		31.79	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pde5a	Q8CG03	865 aa		31.79	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tbc1d23	Q8K0F1	684 aa		31.79	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ndufv1	Q91YT0	464 aa		31.79	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gm43738	A0A0G2JEA5	862 aa		31.78	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Api5	O35841	504 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ltk	P08923	888 aa		31.77	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Marcks	P26645	309 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Usp49	Q6P9L4	685 aa		31.77	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Trim29	Q8R2Q0	587 aa		31.77	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Clstn1	Q9EPL2	979 aa		31.77	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Togaram1	Q6A070	1776 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Aak1	Q3UHJ0	959 aa		31.77	■■■□□ 2.68
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Usp50	Q6P8X6	390 aa		31.77	■■■□□ 2.68

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