RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rps8P62242 208 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa6.97□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cdan1Q8CC12 1239 aa6.97□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kif2cQ922S8 721 aa6.97□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Iqcf3Q9D498 203 aa6.97□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fbxo3Q9DC63 480 aa6.97□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 RfxankQ9Z205 269 aa6.97□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Brca1P48754 1812 aa6.97□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm8765B7ZWJ3 1017 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pdzd7E9Q9W7 1021 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gfra3O35118 397 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cops6O88545 324 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Serpinb2P12388 415 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cbx2P30658 519 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wnt10bP48614 389 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 HgsnatQ3UDW8 656 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm906Q3V0M1 1017 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccdc85aQ5SP85 500 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Specc1Q5SXY1 1067 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Akap4Q60662 849 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc39a11Q8BWY7 342 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pdcd2lQ8C5N5 364 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zbtb9Q8CDC7 459 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Crlf2Q8CII9 359 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ppp1r11Q8K1L5 131 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lman1lQ8VCD3 505 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pcdhb13Q91Y06 796 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccdc81Q9D5W4 654 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Smg9Q9DB90 520 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 GsdmaQ9EST1 446 aa6.96□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AK157302I3ITR1 129 aa6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PlaurP35456 327 aa6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mcm6P97311 821 aa6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Phactr1Q2M3X8 580 aa6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccser2Q3UHI0 833 aa6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 BcanQ61361 883 aa6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Defa-rs10Q64263 91 aa6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 DmknQ6P253 517 aa6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cracr2bQ80ZJ8 394 aa6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lrrc24Q8BHA1 521 aa6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Otud1Q9CUB6 454 aa6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gar1Q9CY66 231 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dydc2Q9D3X8 139 aa6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MsraQ9D6Y7 233 aa6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tgm5Q9D7I9 724 aa6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Isca1Q9D924 129 aa6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Btbd19S4R1I0 287 aa6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Myh1Q5SX40 1942 aa6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adgra2Q91ZV8 1336 aa6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cep350E9Q309 3095 aa6.95□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ank1Q02357 1862 aa6.94□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Myo15bI7HPW8 3033 aa6.94□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Brpf3B2KF05 1204 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kifc2O08672 792 aa6.94□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fzd1O70421 642 aa6.94□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adrb2P18762 418 aa6.94□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bmp4P21275 408 aa6.94□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gjb1P28230 283 aa6.94□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rfx1P48377 963 aa6.94□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CalcaP70160 136 aa6.94□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 LsrQ99KG5 594 aa6.94□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Naa16Q9DBB4 864 aa6.94□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ralgps2Q9ERD6 590 aa6.94□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zcchc17Q9ESX4 241 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sytl4Q9R0Q1 673 aa6.94□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slfn1Q9Z0I7 337 aa6.94□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 S1pr4Q9Z0L1 386 aa6.94□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Stau1Q9Z108 487 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccdc88aQ5SNZ0 1873 aa6.94□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dlg5E9Q9R9 1921 aa6.93□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mageb2A2AHM0 380 aa6.93□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Usp17lbE9Q9U0 468 aa6.93□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Terf1P70371 421 aa6.93□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ell2Q3UKU1 639 aa6.93□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kansl1lQ5DTI6 991 aa6.93□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wwc1Q5SXA9 1104 aa6.93□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Krt74Q6IFZ9 495 aa6.93□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 SvopQ8BFT9 548 aa6.93□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Clca2Q8BG22 942 aa6.93□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem119Q8R138 280 aa6.93□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PlvapQ91VC4 438 aa6.93□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cd209dQ91ZW8 237 aa6.93□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Piezo1E2JF22 2547 aa6.93□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dcaf10A2AKB9 566 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Skor2A7M7C7 1008 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm44503E9PYU5 387 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 TyrobpO54885 114 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pde4aO89084 844 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PtprcP06800 1291 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MaptP10637 733 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Eps15P42567 897 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NcanP55066 1268 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bend4P86174 541 aa6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.7 ms