RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617649.4

ACACA-240, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

TSL 5 BASIC

Gene ACACA, Length 7,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-240	ENST00000617649	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	KIF5A	Q12840	1032 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	TTC16	Q8NEE8	873 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	DNM3	Q9UQ16	869 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ADCY5	O95622	1261 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	CCDC175	P0C221	793 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	OSBP	P22059	807 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	UBXN1	Q04323	297 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	TRIM14	Q14142	442 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ISM2	Q6H9L7	571 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	TRIM37	O94972	964 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	USP14	P54578	494 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	CHST3	Q7LGC8	479 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	KIFC2	Q96AC6	838 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649		A0A1W2PRG0	241 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	BBOX1	O75936	387 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	LIN9	Q5TKA1	542 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	SMC5	Q8IY18	1101 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ESPN	B1AK53	854 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	CHMP2A	O43633	222 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ZEB2	O60315	1214 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	SUCLG2	Q96I99	432 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	NDC80	O14777	642 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	KRT5	P13647	590 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	CCDC42	Q96M95	316 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	NACA2	Q9H009	215 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	NBPF3	Q9H094	633 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	UNC13B	O14795	1591 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ITSN1	Q15811	1721 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	MBD5	Q9P267	1494 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	UBE4A	Q14139	1066 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	USH1G	Q495M9	461 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	GALNT17	Q6IS24	598 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	FAM107B	Q9H098	131 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	CTAGE9	A4FU28	777 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	HSF2BP	O75031	334 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	KRT24	Q2M2I5	525 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	PSMD1	Q99460	953 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	GLI2	P10070	1586 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	SLC27A2	O14975	620 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	CPXCR1	Q8N123	301 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ATP5J	P18859	108 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	CLUL1	Q15846	466 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	CNGA4	Q8IV77	575 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	CEP135	Q66GS9	1140 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	CTR9	Q6PD62	1173 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ACACA-240	ENST00000617649	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		7.41	□□□□□ -1.22

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