RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597777.1

FARP1-222, Transcript of FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 1, human

Gene FARP1, Length 3,841 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FARP1-222	ENST00000597777	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	SNED1	Q8TER0	1413 aa		11.35	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777		B4E1Z4	1266 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	COBL	O75128	1261 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	IL1R1	P14778	569 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	MAST3	O60307	1309 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777		A0A0G2JLW4	131 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	KLRK1	P26718	216 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	TGFB2	P61812	414 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	ANKRD1	Q15327	319 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	HS1BP3	Q53T59	392 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	11.34	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		11.34	□□□□□ -0.59
FARP1-222	ENST00000597777	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	PDE6A	P16499	860 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	AFM	P43652	599 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	USP5	P45974	858 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	POLL	Q9UGP5	575 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	11.33	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	STX17	P56962	302 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	NECTIN1	Q15223	517 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	EYA3	Q99504	573 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		11.33	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	LAMA4	Q16363	1823 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	ERICH4	A6NGS2	130 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	PRC1	O43663	620 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	OSBP2	Q969R2	916 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	TYRO3	Q06418	890 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	TMC6	Q7Z403	805 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	AIFM3	Q96NN9	605 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	COA1	Q9GZY4	146 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	ZMYM6	O95789	1325 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777		M0R2C6	588 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	TTC6	Q86TZ1	520 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	CFAP45	Q9UL16	551 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		11.32	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	CHRNA5	P30532	468 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	SOGA3	Q5TF21	947 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	CD209	Q9NNX6	404 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	NR1I2	O75469	434 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	BRD1	O95696	1058 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	TTLL6	Q8N841	843 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		11.31	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	C6orf229	H3BNL8	230 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	ZBTB7A	O95365	584 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	TNNT1	P13805	278 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	GNAT2	P19087	354 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	VPS33B	Q9H267	617 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	ARMT1	Q9H993	441 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	STX8	Q9UNK0	236 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	KRT32	Q14532	448 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	11.3	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	GPAA1	O43292	621 aa		11.3	□□□□□ -0.6
FARP1-222	ENST00000597777	KCNA3	P22001	575 aa		11.3	□□□□□ -0.6

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