RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 OGDHLQ9ULD0 1010 aa27.08■■□□□ 1.93
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CAPNS1-205ENST00000588780 TRIB2Q92519 343 aa27.07■■□□□ 1.92
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CAPNS1-205ENST00000588780 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
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CAPNS1-205ENST00000588780 USP17L5A8MUK1 530 aa27.02■■□□□ 1.92
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CAPNS1-205ENST00000588780 MORF4L1Q9UBU8 362 aa27■■□□□ 1.91
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CAPNS1-205ENST00000588780 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa26.98■■□□□ 1.91
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CAPNS1-205ENST00000588780 TXNRD2Q9NNW7 524 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-205ENST00000588780 RAI14Q9P0K7 980 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-205ENST00000588780 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
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CAPNS1-205ENST00000588780 ASNSP08243 561 aa26.9■■□□□ 1.9
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CAPNS1-205ENST00000588780 ERVK-9P63128 1117 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-205ENST00000588780 ERVK-24P63145 666 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-205ENST00000588780 GPR142Q7Z601 462 aa26.9■■□□□ 1.9
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