RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560983.1

HERC1-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene HERC1, Length 457 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-211ENST00000560983 PRAG1Q86YV5 1406 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC1-211ENST00000560983 ATP10DQ9P241 1426 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC1-211ENST00000560983 ADGRB2O60241 1585 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC1-211ENST00000560983 MYOM1P52179 1685 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC1-211ENST00000560983 GCC2Q8IWJ2 1684 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC1-211ENST00000560983 RREB1Q92766 1687 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC1-211ENST00000560983 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa5.88□□□□□ -1.47
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HERC1-211ENST00000560983 GSC2O15499 205 aa5.87□□□□□ -1.47
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HERC1-211ENST00000560983 CCDC144AA2RUR9 1427 aa5.87□□□□□ -1.47
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HERC1-211ENST00000560983 PTPN23Q9H3S7 1636 aa5.87□□□□□ -1.47
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HERC1-211ENST00000560983 A6NHS1 94 aa5.85□□□□□ -1.47
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HERC1-211ENST00000560983 C1orf115Q9H7X2 142 aa5.83□□□□□ -1.48
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HERC1-211ENST00000560983 GJD3Q8N144 294 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 CCDC82Q8N4S0 544 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 RNF208Q9H0X6 261 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
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