RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550375.1

BRF1-217, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-217ENST00000550375 PLCD1P51178 756 aa20.59■□□□□ 0.89
BRF1-217ENST00000550375 HUNKP57058 714 aa20.59■□□□□ 0.89
BRF1-217ENST00000550375 CTR9Q6PD62 1173 aa20.59■□□□□ 0.89
BRF1-217ENST00000550375 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
BRF1-217ENST00000550375 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.59■□□□□ 0.89
BRF1-217ENST00000550375 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.59■□□□□ 0.89
BRF1-217ENST00000550375 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
BRF1-217ENST00000550375 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.59■□□□□ 0.89
BRF1-217ENST00000550375 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.58■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.58■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.58■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 NAPBQ9H115 298 aa20.58■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 LAMB1P07942 1786 aa20.57■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 RAD50Q92878 1312 aa20.57■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.57■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 SMIM22K7EJ46 135 aa20.57■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 KLRG1Q96E93 195 aa20.57■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 WRNIP1Q96S55 665 aa20.57■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 SGSM2O43147 1006 aa20.56■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 TBC1D12O60347 775 aa20.56■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 MAP3K11Q16584 847 aa20.56■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 C12orf60Q5U649 245 aa20.56■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 CASC1Q6TDU7 716 aa20.56■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.56■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.56■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 MYH8P13535 1937 aa20.56■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 MAP3K9P80192 1104 aa20.55■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 MAP3K10Q02779 954 aa20.55■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 DYNLL2Q96FJ2 89 aa20.55■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.55■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.55■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 EHD4Q9H223 541 aa20.55■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 DNAJC18Q9H819 358 aa20.55■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 INPP5BP32019 993 aa20.54■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 SBK1Q52WX2 424 aa20.54■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.54■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.53■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 FGAP02671 866 aa20.53■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 GRM1Q13255 1194 aa20.53■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 ALX1Q15699 326 aa20.53■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.53■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.53■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.53■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 PTH1RQ03431 593 aa20.52■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 VGLL4Q14135 290 aa20.52■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.52■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.52■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 ELP3Q9H9T3 547 aa20.52■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 CSADQ9Y600 493 aa20.52■□□□□ 0.88
BRF1-217ENST00000550375 DOCK1Q14185 1865 aa20.51■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 GABPAQ06546 454 aa20.51■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 PPARAQ07869 468 aa20.51■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 RGMBQ6NW40 437 aa20.51■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.51■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 JMYQ8N9B5 988 aa20.51■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.51■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.51■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 RASSF10A6NK89 507 aa20.5■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 SHMT1P34896 483 aa20.5■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 CDK8P49336 464 aa20.5■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.5■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.5■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 GDF11O95390 407 aa20.49■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 HAND2P61296 217 aa20.49■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.49■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.49■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.49■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 SWAP70Q9UH65 585 aa20.49■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.49■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 LAMA4Q16363 1823 aa20.49■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 ZMYM6O95789 1325 aa20.49■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 CAP2P40123 477 aa20.48■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.48■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.48■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.48■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.48■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 PCNTO95613 3336 aa20.48■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 UNCXA6NJT0 531 aa20.47■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 JAG1P78504 1218 aa20.47■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.47■□□□□ 0.87
BRF1-217ENST00000550375 CAPNS2Q96L46 248 aa20.47■□□□□ 0.87
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