RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	GUCD1	Q96NT3	240 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	MRC1	P22897	1456 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	CACNA1B	Q00975	2339 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	SRGN	P10124	158 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	TEAD4	Q15561	434 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF333	Q96JL9	665 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	7.01	□□□□□ -1.29	4e-12	■□□□□ 10.7
PABPC1-223	ENST00000523636	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	NCAPD2	Q15021	1401 aa		7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	SHTN1	A0MZ66	631 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	CCDC93	Q567U6	631 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	WDR44	Q5JSH3	913 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	SHISA4	Q96DD7	197 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	RPTOR	Q8N122	1335 aa		7	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	FKTN	O75072	461 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	STYK1	Q6J9G0	422 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	USP48	Q86UV5	1035 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	TICAM2	Q86XR7	235 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	RNF217	Q8TC41	542 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	AAAS	Q9NRG9	546 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	NARF	Q9UHQ1	456 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	TRIM17	Q9Y577	477 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	SCN7A	Q01118	1682 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	SERTM1	A2A2V5	107 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	TTLL8	A6PVC2	850 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	LGR5	O75473	907 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	BMP1	P13497	986 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	PDE6B	P35913	854 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	SOGA3	Q5TF21	947 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	CERS3	Q8IU89	383 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	STAP2	Q9UGK3	403 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	USP3	Q9Y6I4	520 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	EML1	O00423	815 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF609	O15014	1411 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	NOS2	P35228	1153 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	ZFP42	Q96MM3	310 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	COL15A1	P39059	1388 aa		6.96	□□□□□ -1.29
PABPC1-223	ENST00000523636	ADM5	C9JUS6	153 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PABPC1-223	ENST00000523636	PHKG2	P15735	406 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PABPC1-223	ENST00000523636	TM4SF4	P48230	202 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PABPC1-223	ENST00000523636	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PABPC1-223	ENST00000523636	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PABPC1-223	ENST00000523636	DPF3	Q92784	378 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PABPC1-223	ENST00000523636	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PABPC1-223	ENST00000523636	MASTL	Q96GX5	879 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PABPC1-223	ENST00000523636	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PABPC1-223	ENST00000523636	LAMB1	P07942	1786 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PABPC1-223	ENST00000523636	EGFR	P00533	1210 aa		6.95	□□□□□ -1.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms