RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509784.1

CALCOCO2-216, Transcript of calcium binding and coiled-coil domain 2, human

TSL 4

Gene CALCOCO2, Length 578 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALCOCO2-216	ENST00000509784	WIPF1	O43516	503 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ALX3	O95076	343 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ERVK-24	P63145	666 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RAB33A	Q14088	237 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DYM	Q7RTS9	669 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ST7	Q9NRC1	585 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DISC1	Q9NRI5	854 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FANCG	O15287	622 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DNAJA2	O60884	412 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ADH5	P11766	374 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RING1	Q06587	406 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SERINC3	Q13530	473 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FDX2	Q6P4F2	183 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	USP21	Q9UK80	565 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784		F8W735	103 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GUCY2C	P25092	1073 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ASPA	P45381	313 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TTLL4	Q14679	1199 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NFE2L2	Q16236	605 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RNF214	Q8ND24	703 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAM13C	Q8NE31	585 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ATG4C	Q96DT6	458 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TM9SF2	Q99805	663 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PIDD1	Q9HB75	910 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GMIP	Q9P107	970 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784		A0A1W2PQH9	124 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TIAF1	O95411	115 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NEFM	P07197	916 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GLB1	P16278	677 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NTF4	P34130	210 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ARSH	Q5FYA8	562 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TTC6	Q86TZ1	520 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HID1	Q8IV36	788 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TMEM87B	Q96K49	555 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FBRS	Q9HAH7	460 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DDAH1	O94760	285 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CALCOCO2-216	ENST00000509784	APBA3	O96018	575 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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