RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503393.6

SH3BP2-207, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-207ENST00000503393 MAGEB6Q8N7X4 407 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 PSMB7Q99436 277 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 HELLSQ9NRZ9 838 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 TRPC3Q13507 836 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 GEN1Q17RS7 908 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 PPP2R5EQ16537 467 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 VEZTQ9HBM0 779 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 HOMER3Q9NSC5 361 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 RPS6KA1Q15418 735 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 RXRAP19793 462 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 FBLN1P23142 703 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 ETF1P62495 437 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 NBPF6Q5VWK0 638 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 NBPF4Q96M43 638 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 ITIH3Q06033 890 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 ERCC3P19447 782 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 STAG1Q8WVM7 1258 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 GSDMBQ8TAX9 411 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 CLTAP09496 248 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 VCX3AQ9NNX9 186 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 TNNQ9UQP3 1299 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 TACC3Q9Y6A5 838 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 DEXIO95424 95 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 TNNI2P48788 182 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 PDE4DQ08499 809 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 ZFYVE9O95405 1425 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 CEP104O60308 925 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 RABGGTAQ92696 567 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 CPA1P15085 419 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 PEX26Q7Z412 305 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 SLF1Q9BQI6 1058 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 SLC27A2O14975 620 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 KRT15P19012 456 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 ZMYM3Q14202 1370 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 LRRD1A4D1F6 860 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 LGSNQ5TDP6 509 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 TRIM4Q9C037 500 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 TNFAIP3P21580 790 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 FCHSD1Q86WN1 690 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 ATP8B1O43520 1251 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 ZNF354CQ86Y25 554 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 CD109Q6YHK3 1445 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 KLHL7Q8IXQ5 586 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 COG7P83436 770 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 MAGEA1P43355 309 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 MCM9Q9NXL9 1143 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 PSMD6Q15008 389 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 OPHN1O60890 802 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 TTC16Q8NEE8 873 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 TMEM87BQ96K49 555 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 PLIN2Q99541 437 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 KIAA1468Q9P260 1216 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 PLCG2P16885 1265 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 CDC37L1Q7L3B6 337 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 FAN1Q9Y2M0 1017 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 STX2P32856 288 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 AKAP4Q5JQC9 854 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 BEND3Q5T5X7 828 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 KDM5BQ9UGL1 1544 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 TTC36A6NLP5 189 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 BRD1O95696 1058 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 DUOX2Q9NRD8 1548 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 TSPYL6Q8N831 410 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 ATP1A2P50993 1020 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 ZNF174Q15697 407 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 ATP2A3Q93084 1043 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 Q9H521 79 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 ADKP55263 362 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 TFCP2Q12800 502 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 ZBTB17Q13105 803 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 CCDC105Q8IYK2 499 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 PDE11AQ9HCR9 933 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 CCT6BQ92526 530 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 SNX14Q9Y5W7 946 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 NR1I2O75469 434 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 RILPQ96NA2 401 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP2-207ENST00000503393 KRT5P13647 590 aa17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms