RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	OTOF	Q9HC10	1997 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	ASNS	P08243	561 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	PDE6A	P16499	860 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	GJA5	P36382	358 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	SP3	Q02447	781 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF384	Q8TF68	577 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	PNMA3	Q9UL41	463 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	PTPRA	P18433	802 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP3K10	Q02779	954 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	CRHR2	Q13324	411 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	CABP5	Q9NP86	173 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	USP17L5	A8MUK1	530 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM75P	A6NK02	468 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	PDHX	O00330	501 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	HOXD10	P28358	340 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	CAP2	P40123	477 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM17	Q9Y577	477 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-231	ENST00000496246	BTBD19	C9JJ37	291 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	TLR2	O60603	784 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	GNRH1	P01148	92 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	OSBP	P22059	807 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	ADD2	P35612	726 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	PTPN18	Q99952	460 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	EHD4	Q9H223	541 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	LAMB1	P07942	1786 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM196B	A6NMK8	535 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	MX1	P20591	662 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	SPP2	Q13103	211 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	C19orf81	C9J6K1	198 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	MBD4	O95243	580 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	GNAT2	P19087	354 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	NBPF11	Q86T75	865 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	FEZ1	Q99689	392 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	MYH1	P12882	1939 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	USP14	P54578	494 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	PRMT2	P55345	433 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	ARMT1	Q9H993	441 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	USP17L10	C9JJH3	530 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 159.7 ms