RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	31.09	■■■□□ 2.57	2e-7	■□□□□ 8.5
TTC3-223	ENST00000492275	LAMB1	P07942	1786 aa		31.09	■■■□□ 2.57
TTC3-223	ENST00000492275	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	31.08	■■■□□ 2.57
TTC3-223	ENST00000492275	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		31.08	■■■□□ 2.57
TTC3-223	ENST00000492275	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	31.08	■■■□□ 2.57
TTC3-223	ENST00000492275	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
TTC3-223	ENST00000492275	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	31.08	■■■□□ 2.57
TTC3-223	ENST00000492275	NEFL	P07196	543 aa		31.07	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	31.07	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		31.06	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275		M0R2C6	588 aa		31.06	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		31.06	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	31.06	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	DNAJC18	Q9H819	358 aa		31.06	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	31.06	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		31.05	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	31.05	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	ERO1B	Q86YB8	467 aa		31.05	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		31.05	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		31.05	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	DOCK1	Q14185	1865 aa		31.04	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	HLA-DOA	P06340	250 aa		31.04	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	PLCD1	P51178	756 aa		31.04	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	31.04	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	31.04	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	RILPL2	Q969X0	211 aa		31.04	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	OTUD5	Q96G74	571 aa		31.04	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		31.04	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	31.03	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	TM4SF4	P48230	202 aa		31.03	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	TTC6	Q86TZ1	520 aa		31.03	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		31.03	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		31.03	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	GPAA1	O43292	621 aa		31.02	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	EVX2	Q03828	476 aa		31.02	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		31.01	■■■□□ 2.56
TTC3-223	ENST00000492275	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	31.01	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	FOXN1	O15353	648 aa		31.01	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	31.01	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	TICAM2	Q86XR7	235 aa		31.01	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	31.01	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	EHD4	Q9H223	541 aa		31.01	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		31	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	CYP2D6	P10635	497 aa		31	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	PPAT	Q06203	517 aa		31	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		31	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		31	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	IRF6	O14896	467 aa		30.99	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	CAP2	P40123	477 aa		30.99	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	PPIL2	Q13356	520 aa		30.99	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		30.99	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		30.99	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	30.98	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	PTPRA	P18433	802 aa		30.98	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	SREBF2	Q12772	1141 aa		30.98	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	TTC22	Q5TAA0	569 aa		30.98	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		30.98	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	PICK1	Q9NRD5	415 aa		30.98	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	RNF186	Q9NXI6	227 aa		30.98	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	30.98	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	USP17L12	C9JPN9	530 aa		30.97	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	USP17L21	D6R901	530 aa		30.97	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	30.97	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	INHBE	P58166	350 aa		30.97	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	JAG1	P78504	1218 aa		30.97	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	GABPA	Q06546	454 aa		30.97	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	FAM227B	Q96M60	508 aa		30.97	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		30.96	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	SMIM22	K7EJ46	135 aa		30.96	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	GNAT2	P19087	354 aa		30.96	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	SDS	P20132	328 aa		30.96	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	C12orf60	Q5U649	245 aa		30.96	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		30.96	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	CTR9	Q6PD62	1173 aa		30.96	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		30.96	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		30.96	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	GTF2A2	P52657	109 aa		30.95	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		30.95	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		30.95	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	PTPN18	Q99952	460 aa		30.95	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		30.95	■■■□□ 2.55
TTC3-223	ENST00000492275		A0A0D9SFI3	127 aa		30.94	■■■□□ 2.54
TTC3-223	ENST00000492275	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	30.94	■■■□□ 2.54
TTC3-223	ENST00000492275	CA12	O43570	354 aa		30.94	■■■□□ 2.54
TTC3-223	ENST00000492275	TRPA1	O75762	1119 aa		30.94	■■■□□ 2.54
TTC3-223	ENST00000492275	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	30.94	■■■□□ 2.54
TTC3-223	ENST00000492275	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	30.94	■■■□□ 2.54
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	30.94	■■■□□ 2.54
TTC3-223	ENST00000492275	SKAP1	Q86WV1	359 aa		30.94	■■■□□ 2.54
TTC3-223	ENST00000492275	IFNL1	Q8IU54	200 aa		30.94	■■■□□ 2.54
TTC3-223	ENST00000492275	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		30.94	■■■□□ 2.54
TTC3-223	ENST00000492275	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	30.94	■■■□□ 2.54
TTC3-223	ENST00000492275	TSKS	Q9UJT2	592 aa		30.94	■■■□□ 2.54
TTC3-223	ENST00000492275	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		30.94	■■■□□ 2.54
TTC3-223	ENST00000492275	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	30.93	■■■□□ 2.54
TTC3-223	ENST00000492275	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	30.93	■■■□□ 2.54
TTC3-223	ENST00000492275	SHMT1	P34896	483 aa		30.93	■■■□□ 2.54
TTC3-223	ENST00000492275	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		30.93	■■■□□ 2.54
TTC3-223	ENST00000492275	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		30.93	■■■□□ 2.54
TTC3-223	ENST00000492275	PTPRF	P10586	1907 aa		30.92	■■■□□ 2.54

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