RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485886.1

MVB12B-204, Transcript of multivesicular body subunit 12B, humanhuman

TSL 2

Gene MVB12B, Length 4,537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12B-204ENST00000485886 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 NLRP1Q9C000 1473 aa14.67□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 PREX2Q70Z35 1606 aa14.67□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 PHACTR2O75167 634 aa14.67□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 TCP10Q12799 353 aa14.67□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.67□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.67□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 POSTNQ15063 836 aa14.66□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 BTBD18B2RXH4 712 aa14.66□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 PPP2R5BQ15173 497 aa14.66□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.66□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 RGS12O14924 1447 aa14.66□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 PNOCQ13519 176 aa14.66□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 PI16Q6UXB8 463 aa14.66□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.66□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 PFKFB1P16118 471 aa14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 SIK1P57059 783 aa14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 SCRN1Q12765 414 aa14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 KIAA1468Q9P260 1216 aa14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 CHMP2AO43633 222 aa14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 SLC1A4P43007 532 aa14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 USP37Q86T82 979 aa14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 FANCBQ8NB91 859 aa14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 TNKSO95271 1327 aa14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 BLZF1Q9H2G9 400 aa14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 TAB2Q9NYJ8 693 aa14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.65□□□□□ -0.06
MVB12B-204ENST00000485886 SASH1O94885 1247 aa14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 EVCP57679 992 aa14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 DYMQ7RTS9 669 aa14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 SELENOOQ9BVL4 669 aa14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 HSF2BPO75031 334 aa14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 MYZAPP0CAP1 466 aa14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 KRT9P35527 623 aa14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 GTF2IP78347 998 aa14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 CHRNDQ07001 517 aa14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 PAK1Q13153 545 aa14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 FERMT2Q96AC1 680 aa14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 CARD10Q9BWT7 1032 aa14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.64□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 MTX1Q13505 466 aa14.63□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 ZNF827Q17R98 1081 aa14.63□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 USP21Q9UK80 565 aa14.63□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 ADCY9O60503 1353 aa14.63□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.63□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 BACH1O14867 736 aa14.63□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 GJC1P36383 396 aa14.63□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 KCNQ4P56696 695 aa14.63□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 LRMPQ12912 555 aa14.63□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 UBE4AQ14139 1066 aa14.63□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 CLIC6Q96NY7 704 aa14.63□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 PLVAPQ9BX97 442 aa14.63□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 LONRF3Q496Y0 759 aa14.62□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.62□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 MAST3O60307 1309 aa14.62□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 CUL4AQ13619 759 aa14.62□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.62□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.62□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 FAM212AQ96EL1 285 aa14.62□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 CARD6Q9BX69 1037 aa14.62□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.62□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 UBE3CQ15386 1083 aa14.62□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 SYNCQ9H7C4 482 aa14.62□□□□□ -0.07
MVB12B-204ENST00000485886 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.6 ms