RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.58□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 FZD9O00144 591 aa7.57□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 POLD1P28340 1107 aa7.57□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 MSL1Q68DK7 614 aa7.57□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 NEDD1Q8NHV4 660 aa7.57□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 BRF1Q92994 677 aa7.57□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF287Q9HBT7 754 aa7.57□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 NPHP1O15259 732 aa7.57□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 CDKL5O76039 1030 aa7.57□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 TRDNQ13061 729 aa7.57□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 LMBRD1Q9NUN5 540 aa7.57□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 KIF3AQ9Y496 699 aa7.57□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 RLFQ13129 1914 aa7.57□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 TROAPQ12815 778 aa7.57□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 MKL1Q969V6 931 aa7.57□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 SMC3Q9UQE7 1217 aa7.57□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 CNTNAP1P78357 1384 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 RASA1P20936 1047 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 IARSP41252 1262 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 CRKP46108 304 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 TDO2P48775 406 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 PDE4BQ07343 736 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 FAM83AQ86UY5 434 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 SDR42E1Q8WUS8 393 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 TEKT1Q969V4 418 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 SH3GLB2Q9NR46 395 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 ABCF2Q9UG63 623 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 NFKBIEO00221 500 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 CTDSPL2Q05D32 466 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 APOBRQ0VD83 1088 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 GRM4Q14833 912 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 KLHL40Q2TBA0 621 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC83Q8IWF9 413 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 MIGA1Q8NAN2 632 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 DPF2Q92785 391 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 B4E1Z4 1266 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 C6orf229H3BNL8 230 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.24e-7■■■□□ 15.2
PRKCI-202ENST00000476635 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 DAGLBQ8NCG7 672 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 LZTS2Q9BRK4 669 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 IL17RBQ9NRM6 502 aa7.56□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 PTPRFP10586 1907 aa7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 USP17L12C9JPN9 530 aa7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 USP17L21D6R901 530 aa7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 hCG_1984214I3L0E3 225 aa7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 GTF2IP78347 998 aa7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 PKP1Q13835 747 aa7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 SART3Q15020 963 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 SPDYE2Q495Y8 402 aa7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 MTMR8Q96EF0 704 aa7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 PTPDC1A2A3K4 754 aa7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 FAM198AQ9UFP1 575 aa7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 OLFM4Q6UX06 510 aa7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 BRAPQ7Z569 592 aa7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 WASF1Q92558 559 aa7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 MAF1Q9H063 256 aa7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 TNKSO95271 1327 aa7.54□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa7.54□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa7.54□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 SPDYE2BA6NHP3 402 aa7.54□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 PLA2G6O60733 806 aa7.54□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 KDM4AO75164 1064 aa7.54□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 SPDYE6P0CI01 402 aa7.54□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 CDC27P30260 824 aa7.54□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 WTAPQ15007 396 aa7.54□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.54□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 TTC6Q86TZ1 520 aa7.54□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC17Q96LX7 622 aa7.54□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PRKCI-202ENST00000476635 M0R2N6 131 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms