RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461405.1

PHF20-208, Transcript of PHD finger protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene PHF20, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20-208ENST00000461405 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.55□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.55□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.54□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 HIP1O00291 1037 aa14.54□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 GNAT2P19087 354 aa14.54□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 INPP5BP32019 993 aa14.54□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 GABPAQ06546 454 aa14.54□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 DCAF15Q66K64 600 aa14.54□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 HHIPL1Q96JK4 782 aa14.54□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.54□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 EHD4Q9H223 541 aa14.54□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.54□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.54□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 RAD50Q92878 1312 aa14.54□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 TBC1D12O60347 775 aa14.53□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 HLA-DOAP06340 250 aa14.53□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 VGLL4Q14135 290 aa14.53□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 GIMAP6Q6P9H5 292 aa14.53□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 CTR9Q6PD62 1173 aa14.53□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.53□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 RASAL3Q86YV0 1011 aa14.53□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.53□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 HOOK2Q96ED9 719 aa14.53□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 WRNIP1Q96S55 665 aa14.53□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.53□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 MYH8P13535 1937 aa14.53□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 ZMYM6O95789 1325 aa14.52□□□□□ -0.08
PHF20-208ENST00000461405 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 USP17L12C9JPN9 530 aa14.52□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 USP17L21D6R901 530 aa14.52□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 SGSM2O43147 1006 aa14.52□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 SBK1Q52WX2 424 aa14.52□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 C12orf60Q5U649 245 aa14.52□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 CYP4F22Q6NT55 531 aa14.52□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.52□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa14.52□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 SLC10A3P09131 477 aa14.51□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 SHMT1P34896 483 aa14.51□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 GJA5P36382 358 aa14.51□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 JAG1P78504 1218 aa14.51□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 RGMBQ6NW40 437 aa14.51□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 TTC6Q86TZ1 520 aa14.51□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.51□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa14.51□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.51□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.51□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 TDO2P48775 406 aa14.5□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 MAP3K9P80192 1104 aa14.5□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.5□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 ELP3Q9H9T3 547 aa14.5□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.5□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 PTPRFP10586 1907 aa14.49□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 UNCXA6NJT0 531 aa14.49□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 CDC45O75419 566 aa14.49□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 APPP05067 770 aa14.49□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 VEGFBP49765 207 aa14.49□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 ALX1Q15699 326 aa14.49□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.49□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.49□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 CAPNS2Q96L46 248 aa14.49□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 ZIC5Q96T25 663 aa14.49□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.49□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 NBPF3Q9H094 633 aa14.49□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 NAPBQ9H115 298 aa14.49□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.48□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.48□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 AOC2O75106 756 aa14.48□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 GDF11O95390 407 aa14.48□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 FGAP02671 866 aa14.48□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 CAP2P40123 477 aa14.48□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.48□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.48□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 WNK4Q96J92 1243 aa14.48□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.48□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 KCNA4P22459 653 aa14.47□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 PTH1RQ03431 593 aa14.47□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 PPARAQ07869 468 aa14.47□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 SPRYD7Q5W111 196 aa14.47□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PHF20-208ENST00000461405 OPTNQ96CV9 577 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 147.1 ms