RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 ANTXR2P58335 489 aa28.67■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 DPY19L2Q6NUT2 758 aa28.67■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 CYB5R4Q7L1T6 521 aa28.67■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa28.67■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 KRT23Q9C075 422 aa28.67■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 TOMM22Q9NS69 142 aa28.67■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 PRDM1O75626 825 aa28.66■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 MCM5P33992 734 aa28.66■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 FKBP1CQ5VVH2 108 aa28.66■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 TTC6Q86TZ1 520 aa28.66■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 HSCBQ8IWL3 235 aa28.66■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 TRPM4Q8TD43 1214 aa28.66■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 LRRC2Q9BYS8 371 aa28.66■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 VEZTQ9HBM0 779 aa28.66■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 CNTNAP1P78357 1384 aa28.66■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 KDM4AO75164 1064 aa28.65■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 BECN1Q14457 450 aa28.65■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 ZSWIM5Q9P217 1185 aa28.65■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 ORC4O43929 436 aa28.64■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 PDE4BQ07343 736 aa28.64■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 SLC44A5Q8NCS7 719 aa28.64■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
NME4-209ENST00000460297 PRC1O43663 620 aa28.64■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 SLC4A3P48751 1232 aa28.64■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 Q6ZUG5 572 aa28.64■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 C16orf86Q6ZW13 317 aa28.64■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 ATRNL1Q5VV63 1379 aa28.64■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 GLTPD2A6NH11 291 aa28.63■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 GABPAQ06546 454 aa28.63■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 WDR19Q8NEZ3 1342 aa28.62■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 MCM2P49736 904 aa28.62■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 FAM151AQ8WW52 585 aa28.62■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 MYH8P13535 1937 aa28.62■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 HLA-DOAP06340 250 aa28.61■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 CDK8P49336 464 aa28.61■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 FAM83AQ86UY5 434 aa28.61■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 ESR2Q92731 530 aa28.61■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 AGXT2Q9BYV1 514 aa28.61■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 SERPINB13Q9UIV8 391 aa28.61■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 EHD4Q9H223 541 aa28.61■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 HACL1Q9UJ83 578 aa28.61■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 SLURP2P0DP57 97 aa28.6■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 FBXL16Q8N461 479 aa28.6■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 PI4KBQ9UBF8 816 aa28.6■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 TMEM39BQ9GZU3 492 aa28.59■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 MKNK2Q9HBH9 465 aa28.59■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 RASA1P20936 1047 aa28.58■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 ANKRD1Q15327 319 aa28.58■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 BRF1Q92994 677 aa28.58■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa28.58■■■□□ 2.17
NME4-209ENST00000460297 FGD1P98174 961 aa28.58■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 FAM47AQ5JRC9 791 aa28.58■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa28.58■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 TMX3Q96JJ7 454 aa28.58■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 CSRNP1Q96S65 589 aa28.58■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa28.58■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 DNAJC18Q9H819 358 aa28.58■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 ZNF287Q9HBT7 754 aa28.58■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 PGAP2Q9UHJ9 254 aa28.58■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 CDAN1Q8IWY9 1227 aa28.57■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 TPCN1Q9ULQ1 816 aa28.57■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 SCN4AP35499 1836 aa28.56■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 TNFAIP1Q13829 316 aa28.56■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 RASA3Q14644 834 aa28.56■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 TMEM87BQ96K49 555 aa28.56■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 SWAP70Q9UH65 585 aa28.56■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 LARGE1O95461 756 aa28.55■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 SHMT1P34896 483 aa28.55■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 TNNI2P48788 182 aa28.55■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 WDR90Q96KV7 1748 aa28.55■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 TSPY2A6NKD2 308 aa28.54■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 FAM196BA6NMK8 535 aa28.54■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 TFAP4Q01664 338 aa28.54■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 SENP2Q9HC62 589 aa28.54■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
NME4-209ENST00000460297 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 292.4 ms