RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440447.2

PTX4-202, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-202ENST00000440447 ZNF112Q9UJU3 913 aa21.89■■□□□ 1.09
PTX4-202ENST00000440447 VEGFBP49765 207 aa21.88■■□□□ 1.09
PTX4-202ENST00000440447 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PTX4-202ENST00000440447 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.88■■□□□ 1.09
PTX4-202ENST00000440447 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTX4-202ENST00000440447 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa21.88■■□□□ 1.09
PTX4-202ENST00000440447 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.88■■□□□ 1.09
PTX4-202ENST00000440447 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.88■■□□□ 1.09
PTX4-202ENST00000440447 AK9Q5TCS8 1911 aa21.88■■□□□ 1.09
PTX4-202ENST00000440447 FOCADQ5VW36 1801 aa21.87■■□□□ 1.09
PTX4-202ENST00000440447 FAM196BA6NMK8 535 aa21.87■■□□□ 1.09
PTX4-202ENST00000440447 USP17L12C9JPN9 530 aa21.87■■□□□ 1.09
PTX4-202ENST00000440447 USP17L21D6R901 530 aa21.87■■□□□ 1.09
PTX4-202ENST00000440447 SLURP2P0DP57 97 aa21.87■■□□□ 1.09
PTX4-202ENST00000440447 PLCD1P51178 756 aa21.87■■□□□ 1.09
PTX4-202ENST00000440447 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
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PTX4-202ENST00000440447 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.87■■□□□ 1.09
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PTX4-202ENST00000440447 PHF20L1A8MW92 1017 aa21.86■■□□□ 1.09
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PTX4-202ENST00000440447 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.86■■□□□ 1.09
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PTX4-202ENST00000440447 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
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PTX4-202ENST00000440447 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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PTX4-202ENST00000440447 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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PTX4-202ENST00000440447 C12orf60Q5U649 245 aa21.84■■□□□ 1.09
PTX4-202ENST00000440447 NAPBQ9H115 298 aa21.84■■□□□ 1.09
PTX4-202ENST00000440447 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.84■■□□□ 1.09
PTX4-202ENST00000440447 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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PTX4-202ENST00000440447 DNAJC18Q9H819 358 aa21.83■■□□□ 1.09
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PTX4-202ENST00000440447 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa21.82■■□□□ 1.08
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PTX4-202ENST00000440447 GABPAQ06546 454 aa21.82■■□□□ 1.08
PTX4-202ENST00000440447 SCYL3Q8IZE3 742 aa21.82■■□□□ 1.08
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PTX4-202ENST00000440447 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
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PTX4-202ENST00000440447 SIPA1L1O43166 1804 aa21.78■■□□□ 1.08
PTX4-202ENST00000440447 FGAP02671 866 aa21.78■■□□□ 1.08
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PTX4-202ENST00000440447 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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PTX4-202ENST00000440447 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
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PTX4-202ENST00000440447 PTPRAP18433 802 aa21.77■■□□□ 1.08
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PTX4-202ENST00000440447 CDK8P49336 464 aa21.77■■□□□ 1.08
PTX4-202ENST00000440447 PPIL2Q13356 520 aa21.77■■□□□ 1.08
PTX4-202ENST00000440447 SLC44A5Q8NCS7 719 aa21.77■■□□□ 1.08
PTX4-202ENST00000440447 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.77■■□□□ 1.08
PTX4-202ENST00000440447 IL25Q9H293 177 aa21.77■■□□□ 1.08
PTX4-202ENST00000440447 SGSM2O43147 1006 aa21.76■■□□□ 1.07
PTX4-202ENST00000440447 CDC45O75419 566 aa21.76■■□□□ 1.07
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