RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 IGHA1P01876 353 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 KLRK1P26718 216 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 GJA5P36382 358 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 PTSQ03393 145 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC184Q52MB2 194 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 DACT2Q5SW24 774 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 G2E3Q7L622 706 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 MED23Q9ULK4 1368 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 CFAP99D6REC4 459 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 CCT4P50991 539 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 ARID5BQ14865 1188 aa8.43□□□□□ -1.06
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HOXD8-202ENST00000429017 KSR2Q6VAB6 950 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 PODNQ7Z5L7 613 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 NEURL1BA8MQ27 555 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 H7C1W4 665 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 WNT10BO00744 389 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 SPTLC1O15269 473 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 TBC1D8O95759 1140 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 CASP7P55210 303 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 FKBP1BP68106 108 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
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HOXD8-202ENST00000429017 MYH3P11055 1940 aa8.41□□□□□ -1.06
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HOXD8-202ENST00000429017 DDX58O95786 925 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 CTHP32929 405 aa8.41□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.41□□□□□ -1.06
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HOXD8-202ENST00000429017 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 FZD1Q9UP38 647 aa8.41□□□□□ -1.06
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HOXD8-202ENST00000429017 STRIP1Q5VSL9 837 aa8.4□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa8.4□□□□□ -1.06
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
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HOXD8-202ENST00000429017 AOX1Q06278 1338 aa8.4□□□□□ -1.07
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HOXD8-202ENST00000429017 ZNF804BA4D1E1 1349 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 SLC35F4A4IF30 521 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 TTLL8A6PVC2 850 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 CSF1RP07333 972 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 ITGA6P23229 1130 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 GTF2IP78347 998 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 FOXK2Q01167 660 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 GCKRQ14397 625 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 TTLL5Q6EMB2 1281 aa8.39□□□□□ -1.07
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HOXD8-202ENST00000429017 CERS5Q8N5B7 392 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1B0GUL6 1792 aa8.38□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 MYO3BQ8WXR4 1341 aa8.38□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 GPR25O00155 361 aa8.38□□□□□ -1.07
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HOXD8-202ENST00000429017 NEXNQ0ZGT2 675 aa8.38□□□□□ -1.07
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HOXD8-202ENST00000429017 WWC1Q8IX03 1113 aa8.38□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.38□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 CD209Q9NNX6 404 aa8.38□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 TAF5LO75529 589 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 FSHRP23945 695 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 FOXO4P98177 505 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 FLIIQ13045 1269 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC27Q2M243 656 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 OGFOD1Q8N543 542 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 STK31Q9BXU1 1019 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 HDAC9Q9UKV0 1011 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa8.36□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
HOXD8-202ENST00000429017 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.36□□□□□ -1.07
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