RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 PLCH1Q4KWH8 1693 aa17.99■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 PPP6R2O75170 966 aa17.98■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 PPARAQ07869 468 aa17.98■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 RTN1Q16799 776 aa17.98■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 NOSTRINQ8IVI9 506 aa17.98■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 WNK3Q9BYP7 1800 aa17.98■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 MMP1P03956 469 aa17.98■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 PRR29P0C7W0 189 aa17.98■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 IFNAR1P17181 557 aa17.98■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 ZNF827Q17R98 1081 aa17.98■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 MAP7D2Q96T17 732 aa17.98■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 RAI14Q9P0K7 980 aa17.98■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 TUBE1Q9UJT0 475 aa17.98■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 V9GYY5 206 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 MYH2Q9UKX2 1941 aa17.98■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 CEP135Q66GS9 1140 aa17.97■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 PRDM10Q9NQV6 1147 aa17.97■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 JAG2Q9Y219 1238 aa17.97■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa17.97■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 TIAM2Q8IVF5 1701 aa17.97■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 TMEM232C9JQI7 657 aa17.97■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 WNT7AO00755 349 aa17.97■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa17.97■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa17.97■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 ZNF654Q8IZM8 581 aa17.97■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 PDILTQ8N807 584 aa17.97■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 KRT23Q9C075 422 aa17.97■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 KCNH3Q9ULD8 1083 aa17.97■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 FANCCQ00597 558 aa17.96■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 NYAP1Q6ZVC0 841 aa17.96■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 BPIFA3Q9BQP9 254 aa17.96■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa17.96■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa17.96■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 CNNM2Q9H8M5 875 aa17.96■□□□□ 0.47
NISCH-202ENST00000420808 SPDYE4A6NLX3 237 aa17.95■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 SMTNL1A8MU46 457 aa17.95■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 KRBA2Q6ZNG9 492 aa17.95■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 ANKRD7Q92527 254 aa17.95■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 AK7Q96M32 723 aa17.95■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 TNKSO95271 1327 aa17.95■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 FANCBQ8NB91 859 aa17.95■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 LINC00116Q8NCU8 138 aa17.95■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 CNNM3Q8NE01 707 aa17.95■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 NACAP1Q9BZK3 213 aa17.95■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 VPS54Q9P1Q0 977 aa17.95■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 NMT2O60551 498 aa17.94■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 PLEKHA8P1O95397 391 aa17.94■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 PARP10Q53GL7 1025 aa17.94■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa17.94■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 CABP5Q9NP86 173 aa17.94■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 FANCLQ9NW38 375 aa17.94■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 STK36Q9NRP7 1315 aa17.94■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa17.94■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 CBX1P83916 185 aa17.94■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 SEC23AQ15436 765 aa17.94■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 TIGD1Q96MW7 591 aa17.94■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 ADAMTS3O15072 1205 aa17.93■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 CUTAO60888 179 aa17.93■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 CASP1P29466 404 aa17.93■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 PTPN14Q15678 1187 aa17.93■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 SERTAD1Q9UHV2 236 aa17.93■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa17.93■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 CACNA1SQ13698 1873 aa17.93■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 PDCL2Q8N4E4 241 aa17.93■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 JMYQ8N9B5 988 aa17.93■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 CCDC112Q8NEF3 446 aa17.93■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 UBAC1Q9BSL1 405 aa17.93■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 ZMYND15Q9H091 742 aa17.93■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 ZNF804BA4D1E1 1349 aa17.92■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP17.92■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 INTS13Q9NVM9 706 aa17.92■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 A0A087X0B3 334 aa17.92■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 ERICH2A1L162 156 aa17.92■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 PKN1Q16512 942 aa17.92■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 TRIM22Q8IYM9 498 aa17.92■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 LRRN4CLQ8ND94 238 aa17.92■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
NISCH-202ENST00000420808 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms