RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 PI4KBQ9UBF8 816 aa25.02■■□□□ 1.6
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C4orf48-201ENST00000409248 OTUD5Q96G74 571 aa25.01■■□□□ 1.59
C4orf48-201ENST00000409248 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.01■■□□□ 1.59
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C4orf48-201ENST00000409248 SNAPC2Q13487 334 aa24.94■■□□□ 1.58
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C4orf48-201ENST00000409248 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
C4orf48-201ENST00000409248 CCL15Q16663 113 aa24.92■■□□□ 1.58
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C4orf48-201ENST00000409248 KCNH4Q9UQ05 1017 aa24.91■■□□□ 1.58
C4orf48-201ENST00000409248 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.91■■□□□ 1.58
C4orf48-201ENST00000409248 PHIPQ8WWQ0 1821 aa24.91■■□□□ 1.58
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C4orf48-201ENST00000409248 TBC1D2Q9BYX2 928 aa24.9■■□□□ 1.58
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C4orf48-201ENST00000409248 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.88■■□□□ 1.57
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C4orf48-201ENST00000409248 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
C4orf48-201ENST00000409248 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.87■■□□□ 1.57
C4orf48-201ENST00000409248 PLCD1P51178 756 aa24.86■■□□□ 1.57
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C4orf48-201ENST00000409248 PTPN18Q99952 460 aa24.86■■□□□ 1.57
C4orf48-201ENST00000409248 AS3MTQ9HBK9 375 aa24.86■■□□□ 1.57
C4orf48-201ENST00000409248 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
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