RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393362.8

MAPK9-204, Transcript of mitogen-activated protein kinase 9, human

TSL 5

Gene MAPK9, Length 1,344 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MAPK9-204	ENST00000393362	SP3	Q02447	781 aa		40.63	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	PALD1	Q9ULE6	856 aa		40.63	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	40.62	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	40.62	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		40.62	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		40.61	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		40.61	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	PDE6A	P16499	860 aa		40.6	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		40.6	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		40.6	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	ERO1A	Q96HE7	468 aa		40.6	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	40.6	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	40.6	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	40.6	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		40.59	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	TLR2	O60603	784 aa		40.59	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		40.59	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	40.59	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	TRIM17	Q9Y577	477 aa		40.59	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	CAP2	P40123	477 aa		40.58	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	40.58	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	HAUS7	Q99871	368 aa		40.58	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	DNAJC18	Q9H819	358 aa		40.58	■■■■■ 4.09
MAPK9-204	ENST00000393362	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		40.57	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362	PDHX	O00330	501 aa		40.57	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	40.57	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362	CRBN	Q96SW2	442 aa		40.57	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		40.57	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	40.56	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	40.56	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362	CERS3	Q8IU89	383 aa		40.56	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362	SIPA1L1	O43166	1804 aa		40.55	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		40.55	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		40.54	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362	DOCK1	Q14185	1865 aa		40.54	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362	TRIM75P	A6NK02	468 aa		40.53	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362	USP5	P45974	858 aa		40.53	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362	JAG1	P78504	1218 aa		40.53	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		40.53	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		40.53	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		40.52	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362	C17orf99	Q6UX52	265 aa		40.52	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		40.52	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	40.51	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362	EFCC1	Q9HA90	598 aa		40.51	■■■■■ 4.08
MAPK9-204	ENST00000393362	RGS19	P49795	217 aa		40.5	■■■■■ 4.07
MAPK9-204	ENST00000393362	CHGB	P05060	677 aa		40.49	■■■■■ 4.07
MAPK9-204	ENST00000393362	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	40.49	■■■■■ 4.07
MAPK9-204	ENST00000393362	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	40.49	■■■■■ 4.07
MAPK9-204	ENST00000393362	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		40.49	■■■■■ 4.07
MAPK9-204	ENST00000393362	CPA4	Q9UI42	421 aa		40.49	■■■■■ 4.07
MAPK9-204	ENST00000393362	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		40.49	■■■■■ 4.07
MAPK9-204	ENST00000393362	ADD2	P35612	726 aa		40.48	■■■■■ 4.07
MAPK9-204	ENST00000393362	SPP2	Q13103	211 aa		40.48	■■■■■ 4.07
MAPK9-204	ENST00000393362	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		40.48	■■■■■ 4.07
MAPK9-204	ENST00000393362	HLA-DOA	P06340	250 aa		40.47	■■■■■ 4.07
MAPK9-204	ENST00000393362	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		40.47	■■■■■ 4.07
MAPK9-204	ENST00000393362	USP17L5	A8MUK1	530 aa		40.46	■■■■■ 4.07
MAPK9-204	ENST00000393362	CYP2C8	P10632	490 aa		40.46	■■■■■ 4.07
MAPK9-204	ENST00000393362	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		40.46	■■■■■ 4.07
MAPK9-204	ENST00000393362	LCORL	Q8N3X6	602 aa		40.45	■■■■■ 4.07
MAPK9-204	ENST00000393362	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		40.45	■■■■■ 4.07
MAPK9-204	ENST00000393362	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		40.44	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	PLCD1	P51178	756 aa		40.43	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	40.43	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		40.43	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	40.43	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	GDF11	O95390	407 aa		40.42	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	PTPRF	P10586	1907 aa		40.42	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	SOX10	P56693	466 aa		40.42	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		40.42	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	TTC6	Q86TZ1	520 aa		40.42	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	40.42	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		40.42	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	ARMT1	Q9H993	441 aa		40.42	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		40.42	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	MYH1	P12882	1939 aa		40.41	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	ASNS	P08243	561 aa		40.41	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	CTGF	P29279	349 aa		40.41	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	TREML2	Q5T2D2	321 aa		40.41	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		40.41	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	WDR18	Q9BV38	432 aa		40.41	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	40.41	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	EHD4	Q9H223	541 aa		40.41	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		40.41	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	HTT	P42858	3142 aa		40.4	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	EVX2	Q03828	476 aa		40.4	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		40.4	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		40.39	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	PRKAB2	O43741	272 aa		40.39	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	BCR	P11274	1271 aa		40.39	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	UBE3C	Q15386	1083 aa		40.39	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	40.39	■■■■■ 4.06
MAPK9-204	ENST00000393362	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	40.38	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	HMGCS2	P54868	508 aa		40.38	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	ARHGEF6	Q15052	776 aa		40.38	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		40.38	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	40.38	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	40.38	■■■■■ 4.05
MAPK9-204	ENST00000393362	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		40.38	■■■■■ 4.05

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms