RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 COA1Q9GZY4 146 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 MPNDQ8N594 471 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 ALG1Q9BT22 464 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 MYL10Q9BUA6 226 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
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SNRNP25-201ENST00000293861 SMIM22K7EJ46 135 aa25.03■■□□□ 1.6
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SNRNP25-201ENST00000293861 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.03■■□□□ 1.6
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SNRNP25-201ENST00000293861 RTN1Q16799 776 aa25.02■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.02■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF654Q8IZM8 581 aa25.02■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
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SNRNP25-201ENST00000293861 STYK1Q6J9G0 422 aa25.02■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 SLF2Q8IX21 1173 aa25.02■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa25.02■■□□□ 1.6
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SNRNP25-201ENST00000293861 TPRNQ4KMQ1 711 aa25.01■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.01■■□□□ 1.59
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SNRNP25-201ENST00000293861 IQCA1Q86XH1 822 aa25.01■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 WASF1Q92558 559 aa25.01■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 PHKBQ93100 1093 aa25.01■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 FUCA2Q9BTY2 467 aa25.01■■□□□ 1.59
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SNRNP25-201ENST00000293861 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
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SNRNP25-201ENST00000293861 C2CD5Q86YS7 1000 aa25■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 FANCBQ8NB91 859 aa25■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 H0YIN7 160 aa24.99■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 USP5P45974 858 aa24.99■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24.99■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 KRT40Q6A162 431 aa24.99■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 NUP62CLQ9H1M0 184 aa24.99■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 POLR3EQ9NVU0 708 aa24.99■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.98■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.98■■□□□ 1.59
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SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.593e-8■□□□□ 9.2
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SNRNP25-201ENST00000293861 MCM9Q9NXL9 1143 aa24.98■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 DACT1Q9NYF0 836 aa24.98■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 YEATS4O95619 227 aa24.98■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 NBPF11Q86T75 865 aa24.98■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 EYA3Q99504 573 aa24.98■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC26A6Q9BXS9 759 aa24.98■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.592e-9■□□□□ 9.5
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SNRNP25-201ENST00000293861 KIF28PB7ZC32 967 aa24.97■■□□□ 1.59
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SNRNP25-201ENST00000293861 C12orf60Q5U649 245 aa24.97■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
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SNRNP25-201ENST00000293861 RIMBP2O15034 1052 aa24.96■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 CALM1P0DP23 149 aa24.96■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 CALM2P0DP24 149 aa24.96■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 CALM3P0DP25 149 aa24.96■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 TRIM29Q14134 588 aa24.96■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 PRDM1O75626 825 aa24.96■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 BTDP43251 543 aa24.96■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 UVSSAQ2YD98 709 aa24.96■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 LINC00301Q8NCQ3 95 aa24.96■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 CLSTN2Q9H4D0 955 aa24.96■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 MYH1P12882 1939 aa24.95■■□□□ 1.59
SNRNP25-201ENST00000293861 DEXIO95424 95 aa24.95■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 CYP2D6P10635 497 aa24.95■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 BAG6P46379 1132 aa24.95■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 GTF2IP78347 998 aa24.95■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 MAP3K11Q16584 847 aa24.95■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 OLFM4Q6UX06 510 aa24.95■■□□□ 1.58
SNRNP25-201ENST00000293861 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.95■■□□□ 1.58
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