RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 PRDM10Q9NQV6 1147 aa32.21■■■□□ 2.75
UBP1-201ENST00000283628 PRDM4Q9UKN5 801 aa32.21■■■□□ 2.75
UBP1-201ENST00000283628 GSG1L2A8MUP6 293 aa32.2■■■□□ 2.75
UBP1-201ENST00000283628 MMP1P03956 469 aa32.2■■■□□ 2.75
UBP1-201ENST00000283628 ATP1A3P13637 1013 aa32.2■■■□□ 2.75
UBP1-201ENST00000283628 RCAN1P53805 252 aa32.2■■■□□ 2.75
UBP1-201ENST00000283628 UBASH3AP57075 661 aa32.2■■■□□ 2.75
UBP1-201ENST00000283628 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
UBP1-201ENST00000283628 TRIM22Q8IYM9 498 aa32.2■■■□□ 2.75
UBP1-201ENST00000283628 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.75
UBP1-201ENST00000283628 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
UBP1-201ENST00000283628 BCORQ6W2J9 1755 aa32.2■■■□□ 2.75
UBP1-201ENST00000283628 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 ARMT1Q9H993 441 aa32.2■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 SERPINC1P01008 464 aa32.19■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 EIF5P55010 431 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 LONRF3Q496Y0 759 aa32.19■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 L2HGDHQ9H9P8 463 aa32.19■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 INCENPQ9NQS7 918 aa32.19■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 CCDC87Q9NVE4 849 aa32.19■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 TMTC2Q8N394 836 aa32.19■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 BCL9LQ86UU0 1499 aa32.18■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa32.18■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 SIK1P57059 783 aa32.18■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa32.17■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 VPS72Q15906 364 aa32.17■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 RTN1Q16799 776 aa32.17■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 RILPL1Q5EBL4 403 aa32.17■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 MPHOSPH8Q99549 860 aa32.17■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 A0A0G2JS52 829 aa32.17■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 ATP6V1AP38606 617 aa32.17■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa32.17■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 TACC3Q9Y6A5 838 aa32.17■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 WTAPQ15007 396 aa32.16■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 VSTM4Q8IW00 320 aa32.16■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 ERICH2A1L162 156 aa32.15■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 DEXIO95424 95 aa32.15■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 CRKLP46109 303 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 TDO2P48775 406 aa32.15■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 CFAP100Q494V2 611 aa32.15■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 STK11IPQ8N1F8 1099 aa32.15■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 TMX1Q9H3N1 280 aa32.15■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 BTBD18B2RXH4 712 aa32.14■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 PTPREP23469 700 aa32.14■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 ITPK1Q13572 414 aa32.14■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa32.14■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 FCHSD1Q86WN1 690 aa32.14■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 TAOK2Q9UL54 1235 aa32.14■■■□□ 2.74
UBP1-201ENST00000283628 UBE2Q2LH0YL09 131 aa32.13■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 DPF2Q92785 391 aa32.13■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 NT5DC1Q5TFE4 455 aa32.12■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 SYT10Q6XYQ8 523 aa32.12■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 LCORLQ8N3X6 602 aa32.12■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 C8orf37Q96NL8 207 aa32.12■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 DACH1Q9UI36 760 aa32.12■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 CEP131Q9UPN4 1083 aa32.12■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 RTL9Q8NET4 1388 aa32.12■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 GUCY1A2P33402 732 aa32.12■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 NGLY1Q96IV0 654 aa32.12■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 FANCLQ9NW38 375 aa32.12■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 ZNF831Q5JPB2 1677 aa32.11■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa32.11■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 TOP1P11387 765 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 POSTNQ15063 836 aa32.11■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 CCDC93Q567U6 631 aa32.11■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 SUSD4Q5VX71 490 aa32.11■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 PRKAB2O43741 272 aa32.11■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 MLKLQ8NB16 471 aa32.11■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 ETF1P62495 437 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 PPP2R5BQ15173 497 aa32.1■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 CCDC152Q4G0S7 254 aa32.1■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 KANK3Q6NY19 840 aa32.1■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 TRIML1Q8N9V2 468 aa32.1■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 TOMM22Q9NS69 142 aa32.1■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 LAMB2P55268 1798 aa32.1■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 BMP6P22004 513 aa32.09■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 ELF2Q15723 593 aa32.09■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 KMT5BQ4FZB7 885 aa32.09■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 KCNJ14Q9UNX9 436 aa32.09■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 KCNQ2O43526 872 aa32.09■■■□□ 2.73
UBP1-201ENST00000283628 PARP10Q53GL7 1025 aa32.09■■■□□ 2.73
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