RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Col1a2Q01149 1372 aa7.03□□□□□ -1.28
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ecm29Q6PDI5 1840 aa7.03□□□□□ -1.28
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fam124aD3Z5V4 536 aa7.02□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lrrc32G3XA59 663 aa7.02□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Irf1P15314 329 aa7.02□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NyxP83503 476 aa7.02□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CbarpQ66L44 698 aa7.02□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mon1aQ6PDG8 556 aa7.02□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa7.02□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znf784Q8BI69 297 aa7.02□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem79Q9D709 391 aa7.02□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CsadQ9DBE0 493 aa7.02□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa7.02□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prss30Q9QYZ9 310 aa7.02□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gpc6Q9R087 555 aa7.02□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa7.01□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Oas2E9Q9A9 742 aa7.01□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nedd1P33215 660 aa7.01□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cap1P40124 474 aa7.01□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rps12P63323 132 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Stra8P70278 393 aa7.01□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cers3Q1A3B0 383 aa7.01□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 EappQ5BU09 281 aa7.01□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tll1Q62381 1013 aa7.01□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slain1Q68FF7 579 aa7.01□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm2163Q6PCY5 473 aa7.01□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 GmipQ6PGG2 971 aa7.01□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmc4Q7TQ65 694 aa7.01□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bmt2Q8BXK4 403 aa7.01□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trappc12Q8K2L8 797 aa7.01□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MypnQ5DTJ9 1315 aa7.01□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Myo5bP21271 1818 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfr2E9Q5M4 874 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc39a2G3X943 309 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm13128L7MU96 475 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AlyrefO08583 255 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Map2k3O09110 347 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Apaf1O88879 1249 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CanxP35564 591 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wdr70Q3TWF6 657 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Plekhg5Q66T02 1073 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Best3Q6H1V1 669 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ube2oQ6ZPJ3 1288 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mxd3Q80US8 206 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fbxl21Q8BFZ4 434 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc4a7Q8BTY2 1034 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Amer2Q8CCJ4 672 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 GptQ8QZR5 496 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fam161aQ8QZV6 448 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ndfip2Q91ZP6 311 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bcs1lQ9CZP5 418 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gdpd2Q9ESM6 539 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cd2apQ9JLQ0 637 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NrapQ80XB4 1728 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Myo3bQ1EG27 1305 aa7□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Jbts17Q8CE72 3214 aa6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kank1E9Q238 1360 aa6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm8882E9Q7E4 283 aa6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prkg1P0C605 671 aa6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kcna1P16388 495 aa6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cyp19a1P28649 503 aa6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Celf1P28659 486 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Csrnp3P59055 597 aa6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Samd5Q3V1H9 173 aa6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Laptm4aQ60961 233 aa6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Agtpbp1Q641K1 1218 aa6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pdzrn3Q69ZS0 1063 aa6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem164Q6PHN7 296 aa6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Phf24Q80TL4 400 aa6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Epc2Q8C0I4 808 aa6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cog6Q8R3I3 657 aa6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CpvlQ9D3S9 478 aa6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adarb2Q9JI20 745 aa6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Foxo4Q9WVH3 505 aa6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Map3k15A2AQW0 1331 aa6.99□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 EvplQ9D952 2035 aa6.98□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm43951A0A0N4SUT6 962 aa6.98□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Msl3l2G3X992 371 aa6.98□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Xirp1O70373 1129 aa6.98□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Aplp1Q03157 653 aa6.98□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trmt1Q3TX08 663 aa6.98□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Chpf2Q3UU43 768 aa6.98□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prdm6Q3UZD5 596 aa6.98□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 VeztQ3ZK22 780 aa6.98□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa6.98□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ofd1Q80Z25 1017 aa6.98□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Usp20Q8C6M1 916 aa6.98□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fbxo18Q8K2I9 1042 aa6.98□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Syt17Q920M7 470 aa6.98□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ddx20Q9JJY4 825 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Col11a1Q61245 1804 aa6.97□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 82 ms