RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRJ-202ENST00000440289 MT1LQ93083 61 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRJ-202ENST00000440289 MT1EP04732 61 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRJ-202ENST00000440289 MT1GP13640 62 aa6.13□□□□□ -1.43
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PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRJ-202ENST00000440289 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
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PTPRJ-202ENST00000440289 MDN1Q9NU22 5596 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.79□□□□□ -1.48
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PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.04□□□□□ -1.76
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PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.98□□□□□ -1.77
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PTPRJ-202ENST00000440289 LCE1CQ5T751 118 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP5-8O75690 187 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRJ-202ENST00000440289 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRJ-202ENST00000440289 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRJ-202ENST00000440289 LCE1FQ5T754 118 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRJ-202ENST00000440289 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRJ-202ENST00000440289 PHGR1C9JFL3 82 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRJ-202ENST00000440289 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.74□□□□□ -2.13
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