RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.83□□□□□ -1
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.83□□□□□ -1
CCNDBP1-211ENST00000567434 C8orf87E5RJ46 101 aa8.83□□□□□ -1
CCNDBP1-211ENST00000567434 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.82□□□□□ -1
CCNDBP1-211ENST00000567434 Q6ZQT0 140 aa8.82□□□□□ -1
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1B0GVX0 72 aa8.81□□□□□ -1
CCNDBP1-211ENST00000567434 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CCNDBP1-211ENST00000567434 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CCNDBP1-211ENST00000567434 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.8□□□□□ -1
CCNDBP1-211ENST00000567434 BATFQ16520 125 aa8.78□□□□□ -1
CCNDBP1-211ENST00000567434 NDUFB1O75438 58 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-211ENST00000567434 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.75□□□□□ -1.01
CCNDBP1-211ENST00000567434 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-211ENST00000567434 C9orf118A6NHY6 69 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-211ENST00000567434 A8MWP4 228 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 H3BT86 120 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1W2PPM0 123 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAX1BP3O14907 124 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 NREPQ16612 68 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM236CP0DP71 79 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-211ENST00000567434 HRES1P13985 223 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRR15Q8IV56 129 aa8.61□□□□□ -1.03
CCNDBP1-211ENST00000567434 Q6ZVQ6 151 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-211ENST00000567434 MTURNQ8N3F0 131 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPINK7P58062 85 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-211ENST00000567434 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-211ENST00000567434 K7EQZ3 153 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-211ENST00000567434 BPY2O14599 106 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-211ENST00000567434 hDV103S1A0JD37 113 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-211ENST00000567434 SSPOA2VEC9 5147 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-211ENST00000567434 USH2AO75445 5202 aa8.46□□□□□ -1.06
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CCNDBP1-211ENST00000567434 K7EP34 96 aa8.43□□□□□ -1.06
CCNDBP1-211ENST00000567434 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.43□□□□□ -1.06
CCNDBP1-211ENST00000567434 NDUFS5O43920 106 aa8.42□□□□□ -1.06
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRO0461Q9UI25 63 aa8.42□□□□□ -1.06
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBL5Q9BZL1 73 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 MT2AP02795 61 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 CASC2Q6XLA1 102 aa8.37□□□□□ -1.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.36□□□□□ -1.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 Q8N9L7 120 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 LINC00846Q9NV44 126 aa8.35□□□□□ -1.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 HCG22E2RYF7 251 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 F8W1H4 67 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 MT1FP04733 61 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP10-10P60014 251 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 CXCL6P80162 114 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 Q5W150 140 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGKV2-30P06310 120 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-211ENST00000567434 ETDBQ3ZM63 59 aa8.22□□□□□ -1.09
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.17□□□□□ -1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa8.17□□□□□ -1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 LCE2BO14633 110 aa8.16□□□□□ -1.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 C4orf26Q17RF5 130 aa8.13□□□□□ -1.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACYP1P07311 99 aa8.11□□□□□ -1.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.07□□□□□ -1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.05□□□□□ -1.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.01□□□□□ -1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.99□□□□□ -1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 S4R3F8 94 aa7.98□□□□□ -1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.97□□□□□ -1.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 C5orf47Q569G3 176 aa7.95□□□□□ -1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.95□□□□□ -1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.94□□□□□ -1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 CSAG1Q6PB30 78 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 UQCRQO14949 82 aa7.9□□□□□ -1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 LCA10Q71F78 164 aa7.9□□□□□ -1.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 LINC00643Q86TS7 51 aa7.89□□□□□ -1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATOX1O00244 68 aa7.88□□□□□ -1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.86□□□□□ -1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.86□□□□□ -1.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 H0Y9P7 68 aa7.83□□□□□ -1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1B0GV90 55 aa7.8□□□□□ -1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.8□□□□□ -1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A087WVE0 104 aa7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms