RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 C9orf118A6NHY6 69 aa10.33□□□□□ -0.76
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CMTM3-211ENST00000565922 C14orf132Q9NPU4 83 aa10.3□□□□□ -0.76
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CMTM3-211ENST00000565922 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa10□□□□□ -0.81
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CMTM3-211ENST00000565922 CRCT1Q9UGL9 99 aa9.83□□□□□ -0.84
CMTM3-211ENST00000565922 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa9.81□□□□□ -0.84
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CMTM3-211ENST00000565922 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa9.49□□□□□ -0.89
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CMTM3-211ENST00000565922 USH2AO75445 5202 aa9.38□□□□□ -0.91
CMTM3-211ENST00000565922 LINC00643Q86TS7 51 aa9.35□□□□□ -0.91
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CMTM3-211ENST00000565922 S4R3F8 94 aa9.34□□□□□ -0.91
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CMTM3-211ENST00000565922 ATOX1O00244 68 aa9.28□□□□□ -0.92
CMTM3-211ENST00000565922 CSAG1Q6PB30 78 aa9.27□□□□□ -0.93
CMTM3-211ENST00000565922 SSPOA2VEC9 5147 aa9.27□□□□□ -0.93
CMTM3-211ENST00000565922 H0Y9P7 68 aa9.24□□□□□ -0.93
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CMTM3-211ENST00000565922 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.21□□□□□ -0.94
CMTM3-211ENST00000565922 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CMTM3-211ENST00000565922 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa9.12□□□□□ -0.95
CMTM3-211ENST00000565922 MP68P56378 58 aa9.11□□□□□ -0.95
CMTM3-211ENST00000565922 LINC00208Q96KT6 92 aa9.09□□□□□ -0.95
CMTM3-211ENST00000565922 OCR1Q9BZK8 76 aa9.09□□□□□ -0.95
CMTM3-211ENST00000565922 A8MUN3 132 aa9.07□□□□□ -0.96
CMTM3-211ENST00000565922 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.07□□□□□ -0.96
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