RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 CASC2Q6XLA1 102 aa0.58□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 TEN1Q86WV5 123 aa0.58□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 COA5Q86WW8 74 aa0.58□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 SNX29P2Q8IUI4 249 aa0.58□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 ATG5Q9H1Y0 275 aa0.58□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa0.58□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
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RRN3-204ENST00000561685 CCDC179H3BU77 68 aa0.57□□□□□ -2.32
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RRN3-204ENST00000561685 PYYP10082 97 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 LSM3P62310 102 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 OCIAD2Q56VL3 154 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 MEIG1Q5JSS6 88 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 C2orf82Q6UX34 121 aa0.57□□□□□ -2.32
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RRN3-204ENST00000561685 C12orf57Q99622 126 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 SMIM7Q9BQ49 75 aa0.57□□□□□ -2.32
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RRN3-204ENST00000561685 SEC11CQ9BY50 192 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 NMES1Q9C002 83 aa0.57□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 SAR1AQ9NR31 198 aa0.57□□□□□ -2.32
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RRN3-204ENST00000561685 AKAIN1P0CW23 69 aa0.56□□□□□ -2.32
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RRN3-204ENST00000561685 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa0.56□□□□□ -2.32
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RRN3-204ENST00000561685 CSAG1Q6PB30 78 aa0.56□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 KCNRGQ8N5I3 272 aa0.56□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 TMEM191AQ9H0A3 160 aa0.56□□□□□ -2.32
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RRN3-204ENST00000561685 ORMDL1Q9P0S3 153 aa0.56□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 A0A087WSZ3 146 aa0.55□□□□□ -2.32
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RRN3-204ENST00000561685 S100PP25815 95 aa0.55□□□□□ -2.32
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RRN3-204ENST00000561685 C14orf144Q96I85 54 aa0.55□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 CRIPTQ9P021 101 aa0.55□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 IFITM5A6NNB3 132 aa0.54□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 SLC25A6P12236 298 aa0.54□□□□□ -2.32
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RRN3-204ENST00000561685 GNG4P50150 75 aa0.54□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 UBE2G1P62253 170 aa0.54□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa0.54□□□□□ -2.32
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RRN3-204ENST00000561685 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
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RRN3-204ENST00000561685 MGST2Q99735 147 aa0.54□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 TCEAL7Q9BRU2 100 aa0.54□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 ZFP30Q9Y2G7 519 aa0.54□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa0.53□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa0.53□□□□□ -2.32
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RRN3-204ENST00000561685 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa0.53□□□□□ -2.32
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RRN3-204ENST00000561685 IFITM1P13164 125 aa0.51□□□□□ -2.33
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RRN3-204ENST00000561685 SPINK7P58062 85 aa0.51□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 HSD52Q0P140 79 aa0.51□□□□□ -2.33
RRN3-204ENST00000561685 LINC00299Q6ZSB3 139 aa0.51□□□□□ -2.33
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