RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 NEBP20929 6669 aa5.37□□□□□ -1.55
ACTB-209ENST00000473257 A0A1B0GVX0 72 aa5.37□□□□□ -1.55
ACTB-209ENST00000473257 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.37□□□□□ -1.55
ACTB-209ENST00000473257 DNAL4O96015 105 aa5.35□□□□□ -1.55
ACTB-209ENST00000473257 GHRHP01286 108 aa5.34□□□□□ -1.55
ACTB-209ENST00000473257 PSMB2P49721 201 aa5.34□□□□□ -1.55
ACTB-209ENST00000473257 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.34□□□□□ -1.55
ACTB-209ENST00000473257 MTURNQ8N3F0 131 aa5.34□□□□□ -1.55
ACTB-209ENST00000473257 C8orf87E5RJ46 101 aa5.33□□□□□ -1.56
ACTB-209ENST00000473257 SMIM6P0DI80 62 aa5.33□□□□□ -1.56
ACTB-209ENST00000473257 VAMP8Q9BV40 100 aa5.33□□□□□ -1.56
ACTB-209ENST00000473257 LINC00846Q9NV44 126 aa5.32□□□□□ -1.56
ACTB-209ENST00000473257 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.31□□□□□ -1.56
ACTB-209ENST00000473257 A6NJY4 79 aa5.31□□□□□ -1.56
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.31□□□□□ -1.56
ACTB-209ENST00000473257 A8MWP4 228 aa5.3□□□□□ -1.56
ACTB-209ENST00000473257 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.3□□□□□ -1.56
ACTB-209ENST00000473257 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.3□□□□□ -1.56
ACTB-209ENST00000473257 UBE2V1Q13404 147 aa5.28□□□□□ -1.56
ACTB-209ENST00000473257 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.28□□□□□ -1.56
ACTB-209ENST00000473257 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
ACTB-209ENST00000473257 H3BQ85 93 aa5.25□□□□□ -1.57
ACTB-209ENST00000473257 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.25□□□□□ -1.57
ACTB-209ENST00000473257 COX6CP09669 75 aa5.24□□□□□ -1.57
ACTB-209ENST00000473257 HSD52Q0P140 79 aa5.24□□□□□ -1.57
ACTB-209ENST00000473257 Q6ZQT0 140 aa5.24□□□□□ -1.57
ACTB-209ENST00000473257 DSCR8Q96T75 97 aa5.24□□□□□ -1.57
ACTB-209ENST00000473257 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.23□□□□□ -1.57
ACTB-209ENST00000473257 J3KT08 172 aa5.23□□□□□ -1.57
ACTB-209ENST00000473257 C9JAW5 83 aa5.21□□□□□ -1.58
ACTB-209ENST00000473257 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.21□□□□□ -1.58
ACTB-209ENST00000473257 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.21□□□□□ -1.58
ACTB-209ENST00000473257 NDUFB1O75438 58 aa5.2□□□□□ -1.58
ACTB-209ENST00000473257 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.2□□□□□ -1.58
ACTB-209ENST00000473257 Q6ZVQ6 151 aa5.2□□□□□ -1.58
ACTB-209ENST00000473257 PYY3Q5JQD4 70 aa5.18□□□□□ -1.58
ACTB-209ENST00000473257 MDN1Q9NU22 5596 aa5.17□□□□□ -1.58
ACTB-209ENST00000473257 TSTD3H0UI37 97 aa5.17□□□□□ -1.58
ACTB-209ENST00000473257 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
ACTB-209ENST00000473257 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.15□□□□□ -1.59
ACTB-209ENST00000473257 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.14□□□□□ -1.59
ACTB-209ENST00000473257 IGKV2-30P06310 120 aa5.14□□□□□ -1.59
ACTB-209ENST00000473257 PRR15Q8IV56 129 aa5.14□□□□□ -1.59
ACTB-209ENST00000473257 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.13□□□□□ -1.59
ACTB-209ENST00000473257 KMT2DO14686 5537 aa5.12□□□□□ -1.59
ACTB-209ENST00000473257 NDUFS5O43920 106 aa5.12□□□□□ -1.59
ACTB-209ENST00000473257 Q5W150 140 aa5.12□□□□□ -1.59
ACTB-209ENST00000473257 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ACTB-209ENST00000473257 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.11□□□□□ -1.59
ACTB-209ENST00000473257 MT1BP07438 61 aa5.11□□□□□ -1.59
ACTB-209ENST00000473257 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.11□□□□□ -1.59
ACTB-209ENST00000473257 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.11□□□□□ -1.59
ACTB-209ENST00000473257 A6NN06 94 aa5.1□□□□□ -1.59
ACTB-209ENST00000473257 K7EQZ3 153 aa5.1□□□□□ -1.59
ACTB-209ENST00000473257 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.1□□□□□ -1.59
ACTB-209ENST00000473257 PCP4L1A6NKN8 68 aa5.09□□□□□ -1.59
ACTB-209ENST00000473257 NREPQ16612 68 aa5.09□□□□□ -1.59
ACTB-209ENST00000473257 C4orf26Q17RF5 130 aa5.09□□□□□ -1.59
ACTB-209ENST00000473257 C5orf47Q569G3 176 aa5.09□□□□□ -1.59
ACTB-209ENST00000473257 hDV103S1A0JD37 113 aa5.08□□□□□ -1.6
ACTB-209ENST00000473257 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.07□□□□□ -1.6
ACTB-209ENST00000473257 ATXN8Q156A1 80 aa5.07□□□□□ -1.6
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.06□□□□□ -1.6
ACTB-209ENST00000473257 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.05□□□□□ -1.6
ACTB-209ENST00000473257 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.05□□□□□ -1.6
ACTB-209ENST00000473257 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.05□□□□□ -1.6
ACTB-209ENST00000473257 Q8N9L7 120 aa5.04□□□□□ -1.6
ACTB-209ENST00000473257 M0R143 59 aa5.03□□□□□ -1.6
ACTB-209ENST00000473257 Q5VV11 94 aa5.03□□□□□ -1.6
ACTB-209ENST00000473257 A0A1B0GW54 56 aa5.02□□□□□ -1.61
ACTB-209ENST00000473257 PDE6GP18545 87 aa5.02□□□□□ -1.61
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.02□□□□□ -1.61
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.01□□□□□ -1.61
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP10-5P60370 271 aa5□□□□□ -1.61
ACTB-209ENST00000473257 HCG22E2RYF7 251 aa4.99□□□□□ -1.61
ACTB-209ENST00000473257 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.99□□□□□ -1.61
ACTB-209ENST00000473257 BPY2O14599 106 aa4.97□□□□□ -1.61
ACTB-209ENST00000473257 CASC2Q6XLA1 102 aa4.97□□□□□ -1.61
ACTB-209ENST00000473257 S4R3F8 94 aa4.97□□□□□ -1.61
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP5-9P26371 169 aa4.96□□□□□ -1.62
ACTB-209ENST00000473257 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa4.96□□□□□ -1.62
ACTB-209ENST00000473257 LCA10Q71F78 164 aa4.96□□□□□ -1.62
ACTB-209ENST00000473257 CSAG1Q6PB30 78 aa4.93□□□□□ -1.62
ACTB-209ENST00000473257 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.92□□□□□ -1.62
ACTB-209ENST00000473257 BATFQ16520 125 aa4.91□□□□□ -1.62
ACTB-209ENST00000473257 CXCL6P80162 114 aa4.89□□□□□ -1.63
ACTB-209ENST00000473257 KLKP1Q107X0 134 aa4.89□□□□□ -1.63
ACTB-209ENST00000473257 A0A087WVE0 104 aa4.88□□□□□ -1.63
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.88□□□□□ -1.63
ACTB-209ENST00000473257 A0A1B0GV90 55 aa4.87□□□□□ -1.63
ACTB-209ENST00000473257 IMUPQ9GZP8 106 aa4.87□□□□□ -1.63
ACTB-209ENST00000473257 H3BT86 120 aa4.86□□□□□ -1.63
ACTB-209ENST00000473257 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.83□□□□□ -1.64
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.83□□□□□ -1.64
ACTB-209ENST00000473257 A0A1W2PPM0 123 aa4.82□□□□□ -1.64
ACTB-209ENST00000473257 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa4.82□□□□□ -1.64
ACTB-209ENST00000473257 C9orf118A6NHY6 69 aa4.81□□□□□ -1.64
ACTB-209ENST00000473257 TAX1BP3O14907 124 aa4.81□□□□□ -1.64
ACTB-209ENST00000473257 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.81□□□□□ -1.64
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