RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219302.7

NME3-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME3, Length 1,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-201ENST00000219302 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.56□□□□□ -1.2
NME3-201ENST00000219302 DNAL4O96015 105 aa7.55□□□□□ -1.2
NME3-201ENST00000219302 SPATA45Q537H7 98 aa7.55□□□□□ -1.2
NME3-201ENST00000219302 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.54□□□□□ -1.2
NME3-201ENST00000219302 A6NJY4 79 aa7.54□□□□□ -1.2
NME3-201ENST00000219302 A8MWP4 228 aa7.54□□□□□ -1.2
NME3-201ENST00000219302 UBE2V1Q13404 147 aa7.52□□□□□ -1.21
NME3-201ENST00000219302 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.52□□□□□ -1.21
NME3-201ENST00000219302 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
NME3-201ENST00000219302 VAMP8Q9BV40 100 aa7.48□□□□□ -1.21
NME3-201ENST00000219302 PSMB2P49721 201 aa7.47□□□□□ -1.21
NME3-201ENST00000219302 VPS25Q9BRG1 176 aa7.47□□□□□ -1.21
NME3-201ENST00000219302 J3KT08 172 aa7.46□□□□□ -1.22
NME3-201ENST00000219302 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.46□□□□□ -1.22
NME3-201ENST00000219302 K7ERJ3 54 aa7.45□□□□□ -1.22
NME3-201ENST00000219302 COX6CP09669 75 aa7.45□□□□□ -1.22
NME3-201ENST00000219302 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
NME3-201ENST00000219302 Q6ZQT0 140 aa7.42□□□□□ -1.22
NME3-201ENST00000219302 DSCR8Q96T75 97 aa7.42□□□□□ -1.22
NME3-201ENST00000219302 HSD52Q0P140 79 aa7.4□□□□□ -1.22
NME3-201ENST00000219302 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
NME3-201ENST00000219302 NDUFB1O75438 58 aa7.39□□□□□ -1.23
NME3-201ENST00000219302 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.39□□□□□ -1.23
NME3-201ENST00000219302 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.39□□□□□ -1.23
NME3-201ENST00000219302 C9JAW5 83 aa7.37□□□□□ -1.23
NME3-201ENST00000219302 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.36□□□□□ -1.23
NME3-201ENST00000219302 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.35□□□□□ -1.23
NME3-201ENST00000219302 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.35□□□□□ -1.23
NME3-201ENST00000219302 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.34□□□□□ -1.23
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NME3-201ENST00000219302 PYY3Q5JQD4 70 aa7.33□□□□□ -1.24
NME3-201ENST00000219302 Q6ZVQ6 151 aa7.33□□□□□ -1.24
NME3-201ENST00000219302 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.32□□□□□ -1.24
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NME3-201ENST00000219302 A0A1B0GW54 56 aa7.28□□□□□ -1.24
NME3-201ENST00000219302 PRR15Q8IV56 129 aa7.28□□□□□ -1.24
NME3-201ENST00000219302 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.26□□□□□ -1.25
NME3-201ENST00000219302 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.26□□□□□ -1.25
NME3-201ENST00000219302 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NME3-201ENST00000219302 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.24□□□□□ -1.25
NME3-201ENST00000219302 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.24□□□□□ -1.25
NME3-201ENST00000219302 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.23□□□□□ -1.25
NME3-201ENST00000219302 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.22□□□□□ -1.25
NME3-201ENST00000219302 PDE6GP18545 87 aa7.2□□□□□ -1.26
NME3-201ENST00000219302 NREPQ16612 68 aa7.18□□□□□ -1.26
NME3-201ENST00000219302 hDV103S1A0JD37 113 aa7.17□□□□□ -1.26
NME3-201ENST00000219302 A6NN06 94 aa7.17□□□□□ -1.26
NME3-201ENST00000219302 MT1BP07438 61 aa7.17□□□□□ -1.26
NME3-201ENST00000219302 SMIM6P0DI80 62 aa7.17□□□□□ -1.26
NME3-201ENST00000219302 Q5W150 140 aa7.17□□□□□ -1.26
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NME3-201ENST00000219302 IGKV2-30P06310 120 aa7.16□□□□□ -1.26
NME3-201ENST00000219302 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.16□□□□□ -1.26
NME3-201ENST00000219302 ATXN8Q156A1 80 aa7.15□□□□□ -1.26
NME3-201ENST00000219302 NDUFS5O43920 106 aa7.14□□□□□ -1.27
NME3-201ENST00000219302 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.14□□□□□ -1.27
NME3-201ENST00000219302 K7EQZ3 153 aa7.13□□□□□ -1.27
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NME3-201ENST00000219302 Q5VV11 94 aa7.09□□□□□ -1.27
NME3-201ENST00000219302 C5orf47Q569G3 176 aa7.08□□□□□ -1.28
NME3-201ENST00000219302 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.08□□□□□ -1.28
NME3-201ENST00000219302 KRTAP10-5P60370 271 aa7.06□□□□□ -1.28
NME3-201ENST00000219302 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.05□□□□□ -1.28
NME3-201ENST00000219302 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.05□□□□□ -1.28
NME3-201ENST00000219302 KRTAP5-9P26371 169 aa7.05□□□□□ -1.28
NME3-201ENST00000219302 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.05□□□□□ -1.28
NME3-201ENST00000219302 KMT2DO14686 5537 aa7.03□□□□□ -1.28
NME3-201ENST00000219302 M0R143 59 aa7.02□□□□□ -1.29
NME3-201ENST00000219302 TSTD3H0UI37 97 aa7.01□□□□□ -1.29
NME3-201ENST00000219302 BPY2O14599 106 aa7.01□□□□□ -1.29
NME3-201ENST00000219302 MDN1Q9NU22 5596 aa7□□□□□ -1.29
NME3-201ENST00000219302 HCG22E2RYF7 251 aa7□□□□□ -1.29
NME3-201ENST00000219302 CASC2Q6XLA1 102 aa6.99□□□□□ -1.29
NME3-201ENST00000219302 CSAG1Q6PB30 78 aa6.98□□□□□ -1.29
NME3-201ENST00000219302 Q8N9L7 120 aa6.97□□□□□ -1.29
NME3-201ENST00000219302 S4R3F8 94 aa6.97□□□□□ -1.29
NME3-201ENST00000219302 CXCL6P80162 114 aa6.96□□□□□ -1.3
NME3-201ENST00000219302 LCA10Q71F78 164 aa6.95□□□□□ -1.3
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NME3-201ENST00000219302 KLKP1Q107X0 134 aa6.93□□□□□ -1.3
NME3-201ENST00000219302 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.92□□□□□ -1.3
NME3-201ENST00000219302 H3BT86 120 aa6.9□□□□□ -1.3
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NME3-201ENST00000219302 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.87□□□□□ -1.31
NME3-201ENST00000219302 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.85□□□□□ -1.31
NME3-201ENST00000219302 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
NME3-201ENST00000219302 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.85□□□□□ -1.31
NME3-201ENST00000219302 C9orf118A6NHY6 69 aa6.81□□□□□ -1.32
NME3-201ENST00000219302 TAX1BP3O14907 124 aa6.81□□□□□ -1.32
NME3-201ENST00000219302 CRIPTQ9P021 101 aa6.8□□□□□ -1.32
NME3-201ENST00000219302 IMUPQ9GZP8 106 aa6.79□□□□□ -1.32
NME3-201ENST00000219302 A0A1W2PPM0 123 aa6.77□□□□□ -1.33
NME3-201ENST00000219302 A0A087WVE0 104 aa6.75□□□□□ -1.33
NME3-201ENST00000219302 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.73□□□□□ -1.33
NME3-201ENST00000219302 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.72□□□□□ -1.33
NME3-201ENST00000219302 UBL5Q9BZL1 73 aa6.72□□□□□ -1.33
NME3-201ENST00000219302 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.71□□□□□ -1.34
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