RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365367.1

RNU6-53P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 53, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-53P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-53P-201ENST00000365367 TOMM6Q96B49 74 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 SMIM12Q96EX1 92 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 C2orf88Q9BSF0 95 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 VCX3BQ9H321 246 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 LINC00472Q9H8W2 130 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 VCX3AQ9NNX9 186 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 CYSLTR1Q9Y271 337 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 A0A087WSZ3 146 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 TMEM223A0PJW6 202 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 LINC00862A6NCI5 91 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 C5orf52A6NGY3 159 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 H3BUT2 72 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 PFDN1O60925 122 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 TCL1BO95988 128 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 TAL2Q16559 108 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 FAM74A3Q4VXF1 159 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 SMIM15Q7Z3B0 74 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 PRELID3AQ96N28 172 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 PRO2289Q9P1D8 64 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 LINC01546A6NGU7 62 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 HMSDA8MTL9 139 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 LST1O00453 97 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 ARPC5O15511 151 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 LINC00313P59037 77 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 SMAGPQ0VAQ4 97 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 PMCHL1Q16048 86 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 C4orf26Q17RF5 130 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 CNPY1Q3B7I2 92 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 Q5W150 140 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 TMEM136Q6ZRR5 245 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 LINC00299Q6ZSB3 139 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 ERASQ7Z444 233 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 LINC00518Q8N0U6 118 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 ORMDL3Q8N138 153 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 MTURNQ8N3F0 131 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 CLEC2BQ92478 149 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 OSTCQ9NRP0 149 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 CENPXA8MT69 81 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 PHGR1C9JFL3 82 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 TEX46H3BTG2 121 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 SSNA1O43805 119 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 NDUFC2O95298 119 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 PPP1R17O96001 155 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 SRP19P09132 144 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 COX7BP24311 80 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 S100A5P33763 92 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 CXCL6P80162 114 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 MEIG1Q5JSS6 88 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 Q6ZVQ6 151 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 SCGB3A1Q96QR1 104 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 MAP1LC3AQ9H492 121 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 Q9H521 79 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 MANBALQ9NQG1 85 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 NAT8BQ9UHF3 227 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 H3BRM9 83 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 K7EMI3 77 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 PDE6DO43924 150 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 IGKV4-1P06312 121 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 PET100P0DJ07 73 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 CEBPGP53567 150 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 SEC11AP67812 179 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 ORMDL2Q53FV1 153 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 OCIAD2Q56VL3 154 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 S100A7L2Q5SY68 101 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 TMEM170BQ5T4T1 132 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 SLC25A34Q6PIV7 304 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 Q6ZQY7 126 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 FA2HQ7L5A8 372 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 CEND1Q8N111 149 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 Q8N9L7 120 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 BORCS7Q96B45 105 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 SIGMAR1Q99720 223 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 TTTY13Q9BZ97 58 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 S4R3F8 94 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 A0A0J9YXY3 114 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 A8MUN3 132 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 UMAD1C9J7I0 102 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 TMEM250H0YL14 139 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 HBDP02042 147 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 PPBPP02775 128 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 P0C880 135 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 KRTAP12-3P60328 96 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 ADIRFQ15847 76 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 BAGE3Q86Y29 109 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 PRR15Q8IV56 129 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-53P-201ENST00000365367 SMIM11BQ8TCY0 68 aa0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.4 ms