RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266546.10

CLSTN3-201, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN3, Length 4,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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CLSTN3-201ENST00000266546 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.53□□□□□ -1.2
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CLSTN3-201ENST00000266546 C15orf56Q8N910 161 aa7.52□□□□□ -1.21
CLSTN3-201ENST00000266546 Q8NDZ9 215 aa7.52□□□□□ -1.21
CLSTN3-201ENST00000266546 A0A1W2PNM2 257 aa7.51□□□□□ -1.21
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM229AH3BQW9 127 aa7.51□□□□□ -1.21
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CLSTN3-201ENST00000266546 APLNQ9ULZ1 77 aa7.44□□□□□ -1.22
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CLSTN3-201ENST00000266546 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.38□□□□□ -1.23
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CLSTN3-201ENST00000266546 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.37□□□□□ -1.23
CLSTN3-201ENST00000266546 SPRR4Q96PI1 79 aa7.37□□□□□ -1.23
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CLSTN3-201ENST00000266546 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.3□□□□□ -1.24
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CLSTN3-201ENST00000266546 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.27□□□□□ -1.24
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CLSTN3-201ENST00000266546 C8orf87E5RJ46 101 aa7.26□□□□□ -1.25
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CLSTN3-201ENST00000266546 A0A1B0GVX0 72 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-201ENST00000266546 SPRR1AP35321 89 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-201ENST00000266546 CUBNO60494 3623 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-201ENST00000266546 A0A087WTM6 91 aa7.23□□□□□ -1.25
CLSTN3-201ENST00000266546 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.23□□□□□ -1.25
CLSTN3-201ENST00000266546 TENM3Q9P273 2699 aa7.22□□□□□ -1.25
CLSTN3-201ENST00000266546 Q5VV11 94 aa7.22□□□□□ -1.25
CLSTN3-201ENST00000266546 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.22□□□□□ -1.25
CLSTN3-201ENST00000266546 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.21□□□□□ -1.25
CLSTN3-201ENST00000266546 LCA10Q71F78 164 aa7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-201ENST00000266546 Q75L30 129 aa7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-201ENST00000266546 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-201ENST00000266546 LINC00313P59037 77 aa7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-201ENST00000266546 VWFP04275 2813 aa7.19□□□□□ -1.26
CLSTN3-201ENST00000266546 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.19□□□□□ -1.26
CLSTN3-201ENST00000266546 UQCR11O14957 56 aa7.19□□□□□ -1.26
CLSTN3-201ENST00000266546 TNP2Q05952 138 aa7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-201ENST00000266546 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-201ENST00000266546 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.17□□□□□ -1.26
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CLSTN3-201ENST00000266546 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-201ENST00000266546 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-201ENST00000266546 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-201ENST00000266546 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSTN3-201ENST00000266546 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF861PO60384 105 aa7.1□□□□□ -1.27
CLSTN3-201ENST00000266546 Q6ZR54 194 aa7.09□□□□□ -1.27
CLSTN3-201ENST00000266546 AKAP9Q99996 3911 aa7.07□□□□□ -1.28
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