RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa15.18■□□□□ 0.02
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CAPNS1-216ENST00000628306 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa14.7□□□□□ -0.06
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CAPNS1-216ENST00000628306 Q6ZRX8 168 aa14.68□□□□□ -0.06
CAPNS1-216ENST00000628306 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa14.66□□□□□ -0.06
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CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2BP63146 152 aa14.64□□□□□ -0.07
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