RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 LIMD2Q9BT23 127 aa13.78□□□□□ -0.2
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PTPRJ-208ENST00000615445 SPACA4Q8TDM5 124 aa13.73□□□□□ -0.21
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PTPRJ-208ENST00000615445 IGKV2-30P06310 120 aa13.63□□□□□ -0.23
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PTPRJ-208ENST00000615445 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
PTPRJ-208ENST00000615445 COL6A3P12111 3177 aa13.23□□□□□ -0.29
PTPRJ-208ENST00000615445 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa13.23□□□□□ -0.29
PTPRJ-208ENST00000615445 IGLV7-43P04211 117 aa13.23□□□□□ -0.29
PTPRJ-208ENST00000615445 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRJ-208ENST00000615445 C4orf26Q17RF5 130 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRJ-208ENST00000615445 SPRR4Q96PI1 79 aa13.21□□□□□ -0.3
PTPRJ-208ENST00000615445 DSCR10P59022 87 aa13.2□□□□□ -0.3
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