RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591994.1

RPRD1A-210, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, humanhuman

TSL 2

Gene RPRD1A, Length 2,484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1A-210ENST00000591994 USF3Q68DE3 2245 aa-0.01□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 ZNF815PA8K554 130 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 M0R2T5 61 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 GNG7O60262 68 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 SMIM6P0DI80 62 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 WFDC9Q8NEX5 89 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 AQP10Q96PS8 301 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 SPANXDQ9BXN6 97 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 SPRR2GQ9BYE4 73 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 R4GMQ9 66 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 MUC17Q685J3 4493 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 VPS13CQ709C8 3753 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 ANKARQ7Z5J8 1434 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 A0A0D9SFI3 127 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 TNFP01375 233 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 COX17Q14061 63 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 TDRG1Q3Y452 100 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 CFAP126Q5VTH2 177 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 FAM213BQ8TBF2 198 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 SMIM4Q8WVI0 70 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 U3KQA8 63 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 REV3LO60673 3130 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 SSSCA1O60232 199 aa-0.03□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 PPP1R17O96001 155 aa-0.03□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 MT1GP13640 62 aa-0.03□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 PPP3R2Q96LZ3 170 aa-0.03□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 FAM107BQ9H098 131 aa-0.03□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 PI4KAP42356 2102 aa-0.03□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-0.03□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-0.03□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 FAM25AB3EWG3 89 aa-0.03□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 FAM25CB3EWG5 89 aa-0.03□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 FAM25GB3EWG6 89 aa-0.03□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-0.03□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 C5orf38Q86SI9 138 aa-0.03□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 MT1MQ8N339 61 aa-0.03□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 PP6455Q8WZ26 134 aa-0.03□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 LINC00472Q9H8W2 130 aa-0.03□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa-0.03□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-0.03□□□□□ -2.41
RPRD1A-210ENST00000591994 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa-0.04□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 LYNX1G3V0Z9 82 aa-0.04□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 SARNPP82979 210 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa-0.04□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 MGST2Q99735 147 aa-0.04□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 I3L2K1 104 aa-0.04□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 M0R135 149 aa-0.04□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 APOC2P02655 101 aa-0.04□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 UBA52P62987 128 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 DEFB121Q5J5C9 76 aa-0.04□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 C10orf128Q5T292 105 aa-0.04□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 TTC9CQ8N5M4 171 aa-0.04□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-0.04□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 CENPEQ02224 2701 aa-0.04□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 EYSQ5T1H1 3165 aa-0.04□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 DNAJC13O75165 2243 aa-0.04□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 UQCR11O14957 56 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 TPPP2P59282 170 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 SPAG11BQ08648 103 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 WFDC2Q14508 124 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 SPAG11AQ6PDA7 123 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 LYSTQ99698 3801 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 SCN3BQ9NY72 215 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 PRO0255Q9UI72 69 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 V9GYH0 126 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 BPTFQ12830 3046 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 DLEU1O43261 78 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 MT2AP02795 61 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 SPCS1Q9Y6A9 102 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 WDFY4Q6ZS81 3184 aa-0.06□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 AKAIN1P0CW23 69 aa-0.06□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 CATR1Q13166 79 aa-0.06□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-0.06□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-0.06□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 MYH4Q9Y623 1939 aa-0.06□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 FRYQ5TBA9 3013 aa-0.06□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa-0.06□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 IFNGP01579 166 aa-0.06□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 BAGE2Q86Y30 109 aa-0.06□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-0.06□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-0.06□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 NBEAQ8NFP9 2946 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 LAMA1P25391 3075 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 IGLC7A0M8Q6 106 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 OOSP1A8MZH6 123 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPRD1A-210ENST00000591994 F8VRH5 84 aa-0.07□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms