RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558639.5

PSMA4-208, Transcript of proteasome subunit alpha 4, human

TSL 3

Gene PSMA4, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA4-208	ENST00000558639	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	LINC00158	P58513	81 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	TAL2	Q16559	108 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639		Q6ZVH6	145 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	TIMM17B	O60830	172 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	MT1HL1	P0DM35	61 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	PYY3	Q5JQD4	70 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639		A0A0J9YXY3	114 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	DLEU1	O43261	78 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	COX8A	P10176	69 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	PFN2	P35080	140 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	TSTD3	H0UI37	97 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	IFITM1	P13164	125 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSMA4-208	ENST00000558639		A0A096LNI7	61 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	C12orf57	Q99622	126 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	NDUFC2	O95298	119 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639		A0A1W2PNN7	141 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	UBE2B	P63146	152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	CD164	Q04900	197 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639		M0R143	59 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639		M0R378	163 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	HSD52	Q0P140	79 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSMA4-208	ENST00000558639	NPC2	P61916	151 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639	DAND5	Q8N907	189 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639	SNCG	O76070	127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639	CEND1	Q8N111	149 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639		A6NDN8	102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639	NCR3	O14931	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639	DDT	P30046	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639		A0A0B4J2C4	111 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639		A0A1B0GV90	55 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639		Q1RN00	199 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMA4-208	ENST00000558639	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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