RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 S100A8P05109 93 aa6.28□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 DDTP30046 118 aa6.28□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.28□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 Q8N8P6 123 aa6.28□□□□□ -1.4
C9orf3-211ENST00000463372 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.27□□□□□ -1.41
C9orf3-211ENST00000463372 GHRHP01286 108 aa6.27□□□□□ -1.41
C9orf3-211ENST00000463372 V9GYV3 84 aa6.27□□□□□ -1.41
C9orf3-211ENST00000463372 G0S2P27469 103 aa6.26□□□□□ -1.41
C9orf3-211ENST00000463372 MTURNQ8N3F0 131 aa6.26□□□□□ -1.41
C9orf3-211ENST00000463372 HRES1P13985 223 aa6.25□□□□□ -1.41
C9orf3-211ENST00000463372 CEBPGP53567 150 aa6.25□□□□□ -1.41
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM250H0YL14 139 aa6.24□□□□□ -1.41
C9orf3-211ENST00000463372 K7EMI3 77 aa6.24□□□□□ -1.41
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP10-5P60370 271 aa6.24□□□□□ -1.41
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF345Q14585 488 aa6.24□□□□□ -1.41
C9orf3-211ENST00000463372 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.24□□□□□ -1.41
C9orf3-211ENST00000463372 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
C9orf3-211ENST00000463372 IGFL1Q6UW32 110 aa6.23□□□□□ -1.41
C9orf3-211ENST00000463372 ERASQ7Z444 233 aa6.23□□□□□ -1.41
C9orf3-211ENST00000463372 TOMM6Q96B49 74 aa6.23□□□□□ -1.41
C9orf3-211ENST00000463372 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.23□□□□□ -1.41
C9orf3-211ENST00000463372 CST9LQ9H4G1 147 aa6.23□□□□□ -1.41
C9orf3-211ENST00000463372 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.23□□□□□ -1.41
C9orf3-211ENST00000463372 LCE3BQ5TA77 95 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf3-211ENST00000463372 A8MUU9 505 aa6.21□□□□□ -1.42
C9orf3-211ENST00000463372 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf3-211ENST00000463372 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf3-211ENST00000463372 SMIM13P0DJ93 91 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf3-211ENST00000463372 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf3-211ENST00000463372 ADCYAP1P18509 176 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf3-211ENST00000463372 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.18□□□□□ -1.42
C9orf3-211ENST00000463372 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf3-211ENST00000463372 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
C9orf3-211ENST00000463372 TAL2Q16559 108 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf3-211ENST00000463372 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.17□□□□□ -1.42
C9orf3-211ENST00000463372 A0A1B0GXF2 115 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf3-211ENST00000463372 FA2HQ7L5A8 372 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf3-211ENST00000463372 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.16□□□□□ -1.42
C9orf3-211ENST00000463372 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
C9orf3-211ENST00000463372 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.15□□□□□ -1.42
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.14□□□□□ -1.43
C9orf3-211ENST00000463372 MT1BP07438 61 aa6.14□□□□□ -1.43
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
C9orf3-211ENST00000463372 Q5VV11 94 aa6.14□□□□□ -1.43
C9orf3-211ENST00000463372 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.14□□□□□ -1.43
C9orf3-211ENST00000463372 IGLC3P0DOY3 106 aa6.13□□□□□ -1.43
C9orf3-211ENST00000463372 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.13□□□□□ -1.43
C9orf3-211ENST00000463372 SLC51BQ86UW2 128 aa6.13□□□□□ -1.43
C9orf3-211ENST00000463372 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
C9orf3-211ENST00000463372 NDUFA6P56556 154 aa6.12□□□□□ -1.43
C9orf3-211ENST00000463372 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.11□□□□□ -1.43
C9orf3-211ENST00000463372 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.11□□□□□ -1.43
C9orf3-211ENST00000463372 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
C9orf3-211ENST00000463372 LINC01549A6NIU2 74 aa6.09□□□□□ -1.43
C9orf3-211ENST00000463372 BLOC1S1P78537 153 aa6.08□□□□□ -1.44
C9orf3-211ENST00000463372 LINC00587B1AMM8 73 aa6.07□□□□□ -1.44
C9orf3-211ENST00000463372 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.07□□□□□ -1.44
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.06□□□□□ -1.44
C9orf3-211ENST00000463372 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.06□□□□□ -1.44
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.06□□□□□ -1.44
C9orf3-211ENST00000463372 ADIRFQ15847 76 aa6.05□□□□□ -1.44
C9orf3-211ENST00000463372 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.05□□□□□ -1.44
C9orf3-211ENST00000463372 HERV-K104P63124 156 aa6.03□□□□□ -1.44
C9orf3-211ENST00000463372 COMMD7Q86VX2 200 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf3-211ENST00000463372 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf3-211ENST00000463372 IMUPQ9GZP8 106 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf3-211ENST00000463372 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.99□□□□□ -1.45
C9orf3-211ENST00000463372 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.99□□□□□ -1.45
C9orf3-211ENST00000463372 C11orf86A6NJI1 115 aa5.99□□□□□ -1.45
C9orf3-211ENST00000463372 NDUFC2O95298 119 aa5.99□□□□□ -1.45
C9orf3-211ENST00000463372 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.99□□□□□ -1.45
C9orf3-211ENST00000463372 LST1O00453 97 aa5.98□□□□□ -1.45
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.97□□□□□ -1.45
C9orf3-211ENST00000463372 A0A1W2PNM2 257 aa5.95□□□□□ -1.46
C9orf3-211ENST00000463372 COX7BP24311 80 aa5.95□□□□□ -1.46
C9orf3-211ENST00000463372 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.95□□□□□ -1.46
C9orf3-211ENST00000463372 DSCR10P59022 87 aa5.94□□□□□ -1.46
C9orf3-211ENST00000463372 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
C9orf3-211ENST00000463372 PEA15Q15121 130 aa5.94□□□□□ -1.46
C9orf3-211ENST00000463372 NAT8Q9UHE5 227 aa5.94□□□□□ -1.46
C9orf3-211ENST00000463372 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.93□□□□□ -1.46
C9orf3-211ENST00000463372 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.93□□□□□ -1.46
C9orf3-211ENST00000463372 F8WEM9 126 aa5.93□□□□□ -1.46
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM223A0PJW6 202 aa5.92□□□□□ -1.46
C9orf3-211ENST00000463372 C9JQL5 133 aa5.92□□□□□ -1.46
C9orf3-211ENST00000463372 HBDP02042 147 aa5.91□□□□□ -1.46
C9orf3-211ENST00000463372 LINC01546A6NGU7 62 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-211ENST00000463372 RHEBQ15382 184 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-211ENST00000463372 BAGE3Q86Y29 109 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-211ENST00000463372 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-211ENST00000463372 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-211ENST00000463372 CLEC2BQ92478 149 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-211ENST00000463372 Q6JHZ5 121 aa5.87□□□□□ -1.47
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.87□□□□□ -1.47
C9orf3-211ENST00000463372 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.87□□□□□ -1.47
C9orf3-211ENST00000463372 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.86□□□□□ -1.47
C9orf3-211ENST00000463372 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.8 ms