RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 HSD52Q0P140 79 aa8.98□□□□□ -0.97
CMTM3-215ENST00000568477 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CMTM3-215ENST00000568477 Q6ZRP5 223 aa8.98□□□□□ -0.97
CMTM3-215ENST00000568477 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.98□□□□□ -0.97
CMTM3-215ENST00000568477 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.97□□□□□ -0.97
CMTM3-215ENST00000568477 J3QQQ9 107 aa8.97□□□□□ -0.97
CMTM3-215ENST00000568477 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CMTM3-215ENST00000568477 C10orf25Q5T742 122 aa8.97□□□□□ -0.97
CMTM3-215ENST00000568477 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.97□□□□□ -0.97
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF815PA8K554 130 aa8.96□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 TAL2Q16559 108 aa8.96□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.96□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.96□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.96□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.96□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.96□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 KIAA0087Q14695 138 aa8.95□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 BATFQ16520 125 aa8.95□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.95□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.95□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.95□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.94□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.94□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 REG3GQ6UW15 175 aa8.93□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.92□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.92□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 SPINK8P0C7L1 97 aa8.92□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.92□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.92□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 LINC01600Q96MT4 127 aa8.92□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 PRSS2P07478 247 aa8.91□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 GAGE2EQ4V326 116 aa8.91□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 C2orf82Q6UX34 121 aa8.91□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.91□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.91□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.9□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.9□□□□□ -0.98
CMTM3-215ENST00000568477 FAM168BA1KXE4 195 aa8.89□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 A6NDN8 102 aa8.89□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.89□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 CEND1Q8N111 149 aa8.89□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 HIST1H4GQ99525 98 aa8.89□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.89□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 CKS1BP61024 79 aa8.88□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 C1orf137Q5JT78 98 aa8.88□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 Q8IZM0 81 aa8.88□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 TNXBP22105 4242 aa8.88□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 A0A0J9YXY3 114 aa8.87□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.87□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 A0A1B0GV90 55 aa8.85□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM238C9JI98 176 aa8.85□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 M0QXV9 152 aa8.85□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 TIMM17BO60830 172 aa8.85□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 FXYD2P54710 66 aa8.84□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP10-8P60410 259 aa8.84□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 HERV-K104P63124 156 aa8.84□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 Q6ZVH6 145 aa8.84□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.84□□□□□ -0.99
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.83□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 A6NJY4 79 aa8.83□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 TAX1BP3O14907 124 aa8.83□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 IGLV7-43P04211 117 aa8.83□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 SMIM13P0DJ93 91 aa8.83□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 UBE2BP63146 152 aa8.83□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 SFTA2Q6UW10 78 aa8.83□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.83□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 COX7B2Q8TF08 81 aa8.83□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 CXCL5P42830 114 aa8.82□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 DIRC1Q969H9 104 aa8.82□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.82□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 SPANXCQ9NY87 97 aa8.82□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 A0A1B0GWB2 263 aa8.81□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 LITAFQ99732 161 aa8.81□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.8□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 IFITM1P13164 125 aa8.79□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 C9orf118A6NHY6 69 aa8.78□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 H0Y9J4 135 aa8.78□□□□□ -1
CMTM3-215ENST00000568477 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.77□□□□□ -1.01
CMTM3-215ENST00000568477 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.77□□□□□ -1.01
CMTM3-215ENST00000568477 COPS9Q8WXC6 57 aa8.77□□□□□ -1.01
CMTM3-215ENST00000568477 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.77□□□□□ -1.01
CMTM3-215ENST00000568477 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.76□□□□□ -1.01
CMTM3-215ENST00000568477 C22orf24Q9Y442 160 aa8.76□□□□□ -1.01
CMTM3-215ENST00000568477 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.75□□□□□ -1.01
CMTM3-215ENST00000568477 A4D1N5 150 aa8.74□□□□□ -1.01
CMTM3-215ENST00000568477 K7ERJ3 54 aa8.74□□□□□ -1.01
CMTM3-215ENST00000568477 RAB37Q96AX2 223 aa8.74□□□□□ -1.01
CMTM3-215ENST00000568477 A0A0B4J2C4 111 aa8.72□□□□□ -1.01
CMTM3-215ENST00000568477 CFC1BP0CG36 223 aa8.72□□□□□ -1.01
CMTM3-215ENST00000568477 CFC1P0CG37 223 aa8.72□□□□□ -1.01
CMTM3-215ENST00000568477 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CMTM3-215ENST00000568477 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.72□□□□□ -1.01
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