RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561395.5

TPM1-231, Transcript of tropomyosin 1, human

TSL 5

Gene TPM1, Length 673 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPM1-231	ENST00000561395	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TPM1-231	ENST00000561395	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TPM1-231	ENST00000561395		A0A0B4J2C4	111 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPM1-231	ENST00000561395	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPM1-231	ENST00000561395	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPM1-231	ENST00000561395	LINC00158	P58513	81 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPM1-231	ENST00000561395	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPM1-231	ENST00000561395	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPM1-231	ENST00000561395	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPM1-231	ENST00000561395	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395		M0R2N4	97 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	PFN2	P35080	140 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	COX17	Q14061	63 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395		H3BUT2	72 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	TSPAN13	O95857	204 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395		A0A1W2PPM0	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395		F8WDY8	70 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	FABP2	P12104	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	VAMP3	Q15836	100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395		Q6ZRU5	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395		K7EP34	96 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TPM1-231	ENST00000561395	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395		H7C2G1	150 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	LECT2	O14960	151 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	PSCA	O43653	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	NDUFC2	O95298	119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	WFDC2	Q14508	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395		Q1RN00	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	TRIAP1	O43715	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	SLPI	P03973	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395		Q6ZR54	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	PSMB2	P49721	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395		Q8NDZ9	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	XP32	Q5T750	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395		Q6ZRP5	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	NCR3	O14931	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	TCL1B	O95988	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395		H3BMG7	143 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPM1-231	ENST00000561395	COX6C	P09669	75 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms