RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.18□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.18□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 CKS2P33552 79 aa5.17□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 SEC11AP67812 179 aa5.17□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.17□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.17□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 TIMM17AQ99595 171 aa5.17□□□□□ -1.58
SMAD3-211ENST00000559460 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.17□□□□□ -1.58
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SMAD3-211ENST00000559460 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.16□□□□□ -1.58
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SMAD3-211ENST00000559460 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.15□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 VCX2Q9H322 139 aa5.15□□□□□ -1.59
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SMAD3-211ENST00000559460 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.14□□□□□ -1.59
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SMAD3-211ENST00000559460 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
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SMAD3-211ENST00000559460 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.13□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.13□□□□□ -1.59
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SMAD3-211ENST00000559460 PFN2P35080 140 aa5.12□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.12□□□□□ -1.59
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SMAD3-211ENST00000559460 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.11□□□□□ -1.59
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SMAD3-211ENST00000559460 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.11□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 K7EMI3 77 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 HIST1H2BKO60814 126 aa5.1□□□□□ -1.59
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SMAD3-211ENST00000559460 HIST1H2BJP06899 126 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 HIST1H2BOP23527 126 aa5.1□□□□□ -1.59
SMAD3-211ENST00000559460 HIST1H2BBP33778 126 aa5.1□□□□□ -1.59
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SMAD3-211ENST00000559460 G0S2P27469 103 aa5.09□□□□□ -1.59
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SMAD3-211ENST00000559460 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.09□□□□□ -1.59
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SMAD3-211ENST00000559460 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.08□□□□□ -1.6
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SMAD3-211ENST00000559460 S100A12P80511 92 aa5.07□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 BAGE3Q86Y29 109 aa5.07□□□□□ -1.6
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SMAD3-211ENST00000559460 C5orf52A6NGY3 159 aa5.06□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00614P0C842 121 aa5.06□□□□□ -1.6
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SMAD3-211ENST00000559460 NDUFA6P56556 154 aa5.05□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 C20orf202A1L168 122 aa5.04□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 SPINK8P0C7L1 97 aa5.04□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 COX17Q14061 63 aa5.04□□□□□ -1.6
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SMAD3-211ENST00000559460 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.04□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 FA2HQ7L5A8 372 aa5.04□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 ERG28Q9UKR5 140 aa5.04□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 HSBP1O75506 76 aa5.03□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 MT2AP02795 61 aa5.03□□□□□ -1.6
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SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP10-10P60014 251 aa5.03□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.03□□□□□ -1.6
SMAD3-211ENST00000559460 SERF1AO75920 110 aa5.02□□□□□ -1.61
SMAD3-211ENST00000559460 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SMAD3-211ENST00000559460 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.01□□□□□ -1.61
SMAD3-211ENST00000559460 H3BRM9 83 aa5.01□□□□□ -1.61
SMAD3-211ENST00000559460 AKR1D1P51857 326 aa5.01□□□□□ -1.61
SMAD3-211ENST00000559460 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.01□□□□□ -1.61
SMAD3-211ENST00000559460 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.01□□□□□ -1.61
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