RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
GRSF1-208	ENST00000545193	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		10.68	□□□□□ -0.7
GRSF1-208	ENST00000545193	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		10.68	□□□□□ -0.7
GRSF1-208	ENST00000545193		K7EIL1	84 aa		10.67	□□□□□ -0.7
GRSF1-208	ENST00000545193	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		10.67	□□□□□ -0.7
GRSF1-208	ENST00000545193	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		10.66	□□□□□ -0.7
GRSF1-208	ENST00000545193	NCR3	O14931	201 aa		10.66	□□□□□ -0.7
GRSF1-208	ENST00000545193	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		10.66	□□□□□ -0.7
GRSF1-208	ENST00000545193	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		10.66	□□□□□ -0.7
GRSF1-208	ENST00000545193	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
GRSF1-208	ENST00000545193	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		10.65	□□□□□ -0.7
GRSF1-208	ENST00000545193	COX7C	P15954	63 aa		10.65	□□□□□ -0.7
GRSF1-208	ENST00000545193	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193	MRAP	Q8TCY5	172 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193	C2orf48	Q96LS8	159 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193	MDFI	Q99750	246 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193	KLK12	Q9UKR0	248 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193		H0YGX0	51 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193	PRR34	Q9NV39	138 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC00846	Q9NV44	126 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193	CRYGA	P11844	174 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193		Q8IZM0	81 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193	hADV29S1	A0JD25	119 aa		10.61	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		10.61	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193	CXCL5	P42830	114 aa		10.6	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193	ESRG	Q1W209	222 aa		10.6	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193	ENHO	Q6UWT2	76 aa		10.6	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A087WVE0	104 aa		10.6	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		10.59	□□□□□ -0.71
GRSF1-208	ENST00000545193	KIAA0087	Q14695	138 aa		10.58	□□□□□ -0.72
GRSF1-208	ENST00000545193	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		10.57	□□□□□ -0.72
GRSF1-208	ENST00000545193	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	10.56	□□□□□ -0.72
GRSF1-208	ENST00000545193	DPH3	Q96FX2	82 aa		10.56	□□□□□ -0.72
GRSF1-208	ENST00000545193	OXT	P01178	125 aa		10.56	□□□□□ -0.72
GRSF1-208	ENST00000545193	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		10.56	□□□□□ -0.72
GRSF1-208	ENST00000545193	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		10.55	□□□□□ -0.72
GRSF1-208	ENST00000545193	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	10.55	□□□□□ -0.72
GRSF1-208	ENST00000545193	C4orf26	Q17RF5	130 aa		10.54	□□□□□ -0.72
GRSF1-208	ENST00000545193	ATOX1	O00244	68 aa		10.53	□□□□□ -0.72
GRSF1-208	ENST00000545193	DSCR8	Q96T75	97 aa		10.52	□□□□□ -0.72
GRSF1-208	ENST00000545193	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
GRSF1-208	ENST00000545193		Q6JHZ5	121 aa		10.51	□□□□□ -0.73
GRSF1-208	ENST00000545193	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
GRSF1-208	ENST00000545193	SPAG11B	Q08648	103 aa		10.51	□□□□□ -0.73
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		10.5	□□□□□ -0.73
GRSF1-208	ENST00000545193		Q8N814	137 aa		10.5	□□□□□ -0.73
GRSF1-208	ENST00000545193		Q8NDZ9	215 aa		10.5	□□□□□ -0.73
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM258	P61165	79 aa		10.5	□□□□□ -0.73
GRSF1-208	ENST00000545193	C6orf223	Q8N319	242 aa		10.5	□□□□□ -0.73
GRSF1-208	ENST00000545193	COX17	Q14061	63 aa		10.49	□□□□□ -0.73
GRSF1-208	ENST00000545193		Q5XG85	94 aa		10.49	□□□□□ -0.73
GRSF1-208	ENST00000545193	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		10.49	□□□□□ -0.73
GRSF1-208	ENST00000545193	UPK3B	Q9BT76	320 aa		10.49	□□□□□ -0.73
GRSF1-208	ENST00000545193	CCK	P06307	115 aa		10.48	□□□□□ -0.73
GRSF1-208	ENST00000545193	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		10.48	□□□□□ -0.73
GRSF1-208	ENST00000545193	C6orf99	Q4VX62	202 aa		10.47	□□□□□ -0.73
GRSF1-208	ENST00000545193	C10orf25	Q5T742	122 aa		10.47	□□□□□ -0.73
GRSF1-208	ENST00000545193	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		10.47	□□□□□ -0.73
GRSF1-208	ENST00000545193	USP17L23	D6RBM5	183 aa		10.46	□□□□□ -0.73
GRSF1-208	ENST00000545193	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GRSF1-208	ENST00000545193	SERP2	Q8N6R1	65 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC00167	Q96N53	147 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GRSF1-208	ENST00000545193	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GRSF1-208	ENST00000545193	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GRSF1-208	ENST00000545193	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GRSF1-208	ENST00000545193	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GRSF1-208	ENST00000545193	NDUFC2	O95298	119 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GRSF1-208	ENST00000545193	COL7A1	Q02388	2944 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GRSF1-208	ENST00000545193	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GRSF1-208	ENST00000545193	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GRSF1-208	ENST00000545193	B9D2	Q9BPU9	175 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GRSF1-208	ENST00000545193	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
GRSF1-208	ENST00000545193	C15orf56	Q8N910	161 aa		10.4	□□□□□ -0.75
GRSF1-208	ENST00000545193	MUC7	Q8TAX7	377 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GRSF1-208	ENST00000545193	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GRSF1-208	ENST00000545193		M0R2N4	97 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC00575	Q6W349	94 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GRSF1-208	ENST00000545193	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GRSF1-208	ENST00000545193	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GRSF1-208	ENST00000545193	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GRSF1-208	ENST00000545193	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		10.36	□□□□□ -0.75
GRSF1-208	ENST00000545193	GHRH	P01286	108 aa		10.36	□□□□□ -0.75
GRSF1-208	ENST00000545193	UBL5	Q9BZL1	73 aa		10.35	□□□□□ -0.75
GRSF1-208	ENST00000545193	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
GRSF1-208	ENST00000545193		Q6ZRU5	148 aa		10.34	□□□□□ -0.75
GRSF1-208	ENST00000545193	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		10.34	□□□□□ -0.75
GRSF1-208	ENST00000545193		Q6ZQY7	126 aa		10.33	□□□□□ -0.76
GRSF1-208	ENST00000545193		Q6ZQT0	140 aa		10.32	□□□□□ -0.76
GRSF1-208	ENST00000545193	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		10.31	□□□□□ -0.76
GRSF1-208	ENST00000545193	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		10.3	□□□□□ -0.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 184.1 ms