RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-208ENST00000502484 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-208ENST00000502484 CARD19Q96LW7 228 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-208ENST00000502484 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-208ENST00000502484 TRACP01848 142 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-208ENST00000502484 TENM2Q9NT68 2774 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-208ENST00000502484 C15orf56Q8N910 161 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 H0YGX0 51 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 C2orf48Q96LS8 159 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 Q8NDZ9 215 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 UPK3BQ9BT76 320 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM126AQ9H061 195 aa5.44□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 LYSTQ99698 3801 aa5.43□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.43□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 F8WDY8 70 aa5.43□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 Q6ZRU5 148 aa5.42□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 NCR3O14931 201 aa5.42□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 Q9HAA7 133 aa5.42□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 A0A087WYN8 130 aa5.41□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.41□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 DNAL4O96015 105 aa5.4□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.4□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.4□□□□□ -1.54
PDE4D-208ENST00000502484 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.4□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 CDIP1Q9H305 208 aa5.4□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.4□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 LECT2O14960 151 aa5.39□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 IGLV6-57P01721 117 aa5.39□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 RMI2Q96E14 147 aa5.39□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 C22orf24Q9Y442 160 aa5.39□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1B0GX51 115 aa5.39□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 SYCNQ0VAF6 134 aa5.39□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.38□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.38□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 SIGMAR1Q99720 223 aa5.38□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 C6orf99Q4VX62 202 aa5.38□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 APLNQ9ULZ1 77 aa5.38□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 NUPR2A6NF83 97 aa5.37□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 VPREB1P12018 145 aa5.37□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 Q6ZRP5 223 aa5.37□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00167Q96N53 147 aa5.37□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 USP17L23D6RBM5 183 aa5.37□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 C3orf84H3BNL1 204 aa5.37□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 CASC10Q5T4H9 136 aa5.37□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 Q8N814 137 aa5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 SLPIP03973 132 aa5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 GAGE2EQ4V326 116 aa5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.36□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.35□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.35□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 M0R378 163 aa5.35□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00575Q6W349 94 aa5.35□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 SNCGO76070 127 aa5.34□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.34□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 XGP55808 180 aa5.34□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa5.34□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.34□□□□□ -1.55
PDE4D-208ENST00000502484 DIRC1Q969H9 104 aa5.34□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.34□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.33□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 hADV29S1A0JD25 119 aa5.33□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 MT-ATP8P03928 68 aa5.33□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 ACYP1P07311 99 aa5.32□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 SCGB1A1P11684 91 aa5.32□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.32□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.32□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.32□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.31□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 COX7BP24311 80 aa5.3□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.3□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.3□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.3□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.3□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.29□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.29□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 PSCAO43653 123 aa5.29□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.29□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 Q6ZQY7 126 aa5.29□□□□□ -1.56
PDE4D-208ENST00000502484 C7orf33Q8WU49 177 aa5.29□□□□□ -1.56
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