RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.5□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.5□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 LITAFQ99732 161 aa7.5□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.5□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 TAL2Q16559 108 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 GAGE2BQ13066 116 aa7.48□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.48□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 A0A096LNI7 61 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 A0A0U1RRA0 63 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 GAGE2EQ4V326 116 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-211ENST00000488243 NDUFC2O95298 119 aa7.46□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 Q6ZSA8 131 aa7.46□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.46□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.46□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.46□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 HIST1H4GQ99525 98 aa7.46□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.46□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 PRO1933Q9H354 126 aa7.45□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.44□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.44□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 HSD52Q0P140 79 aa7.44□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 LINC01620Q4KN68 170 aa7.44□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 DPH3Q96FX2 82 aa7.44□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.44□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP10-1P60331 282 aa7.43□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 Q5VSD8 79 aa7.43□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.43□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 DAND5Q8N907 189 aa7.43□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.43□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.42□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.42□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 A6NJY4 79 aa7.42□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 CHTF8P0CG12 524 aa7.41□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 VPREB1P12018 145 aa7.41□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 CEND1Q8N111 149 aa7.41□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.41□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.41□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 A0A087WYN8 130 aa7.4□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 M0R378 163 aa7.4□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.4□□□□□ -1.22
NISCH-211ENST00000488243 M0R143 59 aa7.39□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 DDTP30046 118 aa7.39□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 XGP55808 180 aa7.39□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 NPC2P61916 151 aa7.39□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PNN7 141 aa7.38□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 PANO1I0J062 215 aa7.38□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.38□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 C22orf24Q9Y442 160 aa7.38□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.37□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 A4D1N5 150 aa7.37□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 M0QXV9 152 aa7.37□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.37□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.37□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.36□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 FAM168BA1KXE4 195 aa7.36□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 CTAG1AP78358 180 aa7.36□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 SCXQ7RTU7 201 aa7.36□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 TMEM126AQ9H061 195 aa7.36□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 A0A0B4J2C4 111 aa7.35□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 J3QL48 77 aa7.35□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.35□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.35□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 C7orf33Q8WU49 177 aa7.35□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.34□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 IGKV2D-28P01615 120 aa7.34□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 HAMPP81172 84 aa7.34□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 Q8NDZ9 215 aa7.34□□□□□ -1.23
NISCH-211ENST00000488243 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.33□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 NCR3O14931 201 aa7.33□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 IGLV6-57P01721 117 aa7.33□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.33□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 LINC00167Q96N53 147 aa7.33□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 A0A1B0GWB2 263 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 A6NDN8 102 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 FAM229AH3BQW9 127 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 CFC1BP0CG36 223 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 CFC1P0CG37 223 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 FXYD2P54710 66 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 UBE2BP63146 152 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 RAB37Q96AX2 223 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 PRYO14603 147 aa7.31□□□□□ -1.24
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