RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM126A	Q9H061	195 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GCFC2-208	ENST00000472230	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GCFC2-208	ENST00000472230	CASC10	Q5T4H9	136 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GCFC2-208	ENST00000472230	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GCFC2-208	ENST00000472230	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GCFC2-208	ENST00000472230	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GCFC2-208	ENST00000472230	CARD19	Q96LW7	228 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GCFC2-208	ENST00000472230		H0YGX0	51 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GCFC2-208	ENST00000472230		M0QXV9	152 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GCFC2-208	ENST00000472230	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GCFC2-208	ENST00000472230		Q8NDZ9	215 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GCFC2-208	ENST00000472230	TEN1	Q86WV5	123 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GCFC2-208	ENST00000472230		J3QR89	54 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GCFC2-208	ENST00000472230	RNF151	Q2KHN1	245 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GCFC2-208	ENST00000472230	TRAC	P01848	142 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GCFC2-208	ENST00000472230	GAGE2E	Q4V326	116 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GCFC2-208	ENST00000472230	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GCFC2-208	ENST00000472230		H3BT86	120 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GCFC2-208	ENST00000472230	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
GCFC2-208	ENST00000472230	LECT2	O14960	151 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GCFC2-208	ENST00000472230	PSCA	O43653	123 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GCFC2-208	ENST00000472230	TTC32	Q5I0X7	151 aa		12	□□□□□ -0.49
GCFC2-208	ENST00000472230		Q6ZRP5	223 aa		12	□□□□□ -0.49
GCFC2-208	ENST00000472230	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC01600	Q96MT4	127 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GCFC2-208	ENST00000472230	DNAL4	O96015	105 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GCFC2-208	ENST00000472230	SLPI	P03973	132 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A087WYN8	130 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GCFC2-208	ENST00000472230	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GCFC2-208	ENST00000472230	VPREB1	P12018	145 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GCFC2-208	ENST00000472230	VPS25	Q9BRG1	176 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GCFC2-208	ENST00000472230	IGLV6-57	P01721	117 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GCFC2-208	ENST00000472230	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GCFC2-208	ENST00000472230	C6orf99	Q4VX62	202 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GCFC2-208	ENST00000472230		M0R378	163 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GCFC2-208	ENST00000472230	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GCFC2-208	ENST00000472230	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GCFC2-208	ENST00000472230	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
GCFC2-208	ENST00000472230	SNCG	O76070	127 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GCFC2-208	ENST00000472230	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GCFC2-208	ENST00000472230	C14orf177	Q52M58	125 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GCFC2-208	ENST00000472230	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GCFC2-208	ENST00000472230	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GCFC2-208	ENST00000472230	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A1B0GX51	115 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GCFC2-208	ENST00000472230	GAGE2B	Q13066	116 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GCFC2-208	ENST00000472230	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		11.89	□□□□□ -0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	DIRC1	Q969H9	104 aa		11.89	□□□□□ -0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		11.88	□□□□□ -0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		11.87	□□□□□ -0.51
GCFC2-208	ENST00000472230		Q8N814	137 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GCFC2-208	ENST00000472230		M0R2N4	97 aa		11.85	□□□□□ -0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		11.85	□□□□□ -0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		11.85	□□□□□ -0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC00575	Q6W349	94 aa		11.85	□□□□□ -0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	DNHD1	Q96M86	4753 aa		11.84	□□□□□ -0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
GCFC2-208	ENST00000472230	hADV29S1	A0JD25	119 aa		11.83	□□□□□ -0.52
GCFC2-208	ENST00000472230	COX7B	P24311	80 aa		11.83	□□□□□ -0.52
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC00167	Q96N53	147 aa		11.83	□□□□□ -0.52
GCFC2-208	ENST00000472230	C7orf33	Q8WU49	177 aa		11.81	□□□□□ -0.52
GCFC2-208	ENST00000472230	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		11.81	□□□□□ -0.52
GCFC2-208	ENST00000472230	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		11.81	□□□□□ -0.52
GCFC2-208	ENST00000472230	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		11.8	□□□□□ -0.52
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM168B	A1KXE4	195 aa		11.8	□□□□□ -0.52
GCFC2-208	ENST00000472230		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
GCFC2-208	ENST00000472230	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		11.79	□□□□□ -0.52
GCFC2-208	ENST00000472230	C22orf24	Q9Y442	160 aa		11.79	□□□□□ -0.52
GCFC2-208	ENST00000472230	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
GCFC2-208	ENST00000472230	C16orf90	A8MZG2	172 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	LYST	Q99698	3801 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A096LNI7	61 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	PRY	O14603	147 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	LY6G6C	O95867	125 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230		Q6ZQY7	126 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230		Q6ZR54	194 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	TENM2	Q9NT68	2774 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230		H3BQ85	93 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		11.71	□□□□□ -0.53

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