RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384580.1

RNU6-1127P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1127, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1127P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1127P-201ENST00000384580 LINC01600Q96MT4 127 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 UQCR10Q9UDW1 63 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 PCNTO95613 3336 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 MUC3AQ02505 3323 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 CATR1Q13166 79 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 ARL11Q969Q4 196 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 FMN2Q9NZ56 1722 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 DNAH14Q0VDD8 3507 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SELENOWP63302 87 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 C5orf38Q86SI9 138 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 FAM223AQ8IWN6 122 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 LINC00474Q9P2X8 69 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 MYH7P12883 1935 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 TCHHQ07283 1943 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 GNG7O60262 68 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 APOC2P02655 101 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 LINC00470Q9BZP3 86 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 ARHGEF5Q12774 1597 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 PRO1933Q9H354 126 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 VPS13CQ709C8 3753 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 MT1FP04733 61 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 ASIPP42127 132 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1127P-201ENST00000384580 TET3O43151 1660 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 DEFB1P60022 68 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 BTG2P78543 158 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 LCN9Q8WX39 176 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 PHLPP1O60346 1717 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 MT1EP04732 61 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 NAIPQ13075 1403 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 KNDC1Q76NI1 1749 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 FOCADQ5VW36 1801 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 CDH23Q9H251 3354 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SHROOM2Q13796 1616 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 A0A1B0GWA3 101 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SEC11AP67812 179 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 DEFB112Q30KQ8 113 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 MT1LQ93083 61 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 A0A0G2JMZ2 1700 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 FGF7P21781 194 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 GNG11P61952 73 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 MBD5Q9P267 1494 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 CEP250Q9BV73 2442 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 OOSP1A8MZH6 123 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 TRAPPC2P0DI81 140 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 CCDC58Q4VC31 144 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SFTA2Q6UW10 78 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 C9orf62Q8N4C0 152 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 MANBALQ9NQG1 85 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 CCDC141Q6ZP82 1450 aa-1.41□□□□□ -2.63
RNU6-1127P-201ENST00000384580 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 C9orf153Q5TBE3 101 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 CRIPTQ9P021 101 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 SCN7AQ01118 1682 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 FAM223BA6NKX1 122 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 F6UZH7 168 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 K7EP34 96 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 ADGRL2O95490 1459 aa-1.43□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 I3L3M4 83 aa-1.43□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 COX6CP09669 75 aa-1.43□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 AKAIN1P0CW23 69 aa-1.43□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 Q0VG73 95 aa-1.43□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 BRCA2P51587 3418 aa-1.43□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 NLRP1Q9C000 1473 aa-1.43□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 NUP188Q5SRE5 1749 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 UNC13AQ9UPW8 1703 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 A0A1B0GU69 56 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 NDUFA2O43678 99 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 C12orf57Q99622 126 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 COL4A6Q14031 1691 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 QRICH2Q9H0J4 1663 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1127P-201ENST00000384580 FAM24AA6NFZ4 105 aa-1.46□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.2 ms