RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.81□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.81□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 NDUFC2O95298 119 aa6.81□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.8□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.8□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.8□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 SCXQ7RTU7 201 aa6.79□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.79□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.78□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 F8WDY8 70 aa6.78□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00643Q86TS7 51 aa6.78□□□□□ -1.32
TTPAL-202ENST00000372904 REG3GQ6UW15 175 aa6.77□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 ZZEF1O43149 2961 aa6.77□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 PDE6GP18545 87 aa6.77□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 C3orf84H3BNL1 204 aa6.77□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 TACC2O95359 2948 aa6.76□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.76□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.76□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 FLNCQ14315 2725 aa6.76□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 A0A1B0GX51 115 aa6.75□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 CCKP06307 115 aa6.75□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.75□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 UPK3BQ9BT76 320 aa6.75□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.75□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 XGP55808 180 aa6.74□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 NDUFS5O43920 106 aa6.74□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00575Q6W349 94 aa6.74□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.74□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 ITPR1Q14643 2758 aa6.74□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.74□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.74□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 C22orf24Q9Y442 160 aa6.74□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 FAM104AQ969W3 186 aa6.73□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.72□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 C7orf33Q8WU49 177 aa6.72□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.71□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 BPY2O14599 106 aa6.71□□□□□ -1.33
TTPAL-202ENST00000372904 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 PRYO14603 147 aa6.71□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 PRO0461Q9UI25 63 aa6.71□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 PRR34Q9NV39 138 aa6.71□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 ATOX1O00244 68 aa6.7□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 Q6ZRP5 223 aa6.7□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.7□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 H0Y9J4 135 aa6.7□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 B5MCH6 92 aa6.7□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 PRLHP81277 87 aa6.7□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 C15orf56Q8N910 161 aa6.69□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 FAM168BA1KXE4 195 aa6.69□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 KIAA0087Q14695 138 aa6.69□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00167Q96N53 147 aa6.69□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 WIPF1O43516 503 aa6.68□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 NDUFB1O75438 58 aa6.68□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 C1orf137Q5JT78 98 aa6.66□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.66□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.66□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.65□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 CASC10Q5T4H9 136 aa6.65□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.65□□□□□ -1.34
TTPAL-202ENST00000372904 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.65□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.65□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 CHTF8P0CG12 524 aa6.65□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.64□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.64□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 Q9BRP9 147 aa6.64□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 CHD6Q8TD26 2715 aa6.63□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 VPREB1P12018 145 aa6.63□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 CDIP1Q9H305 208 aa6.63□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 RTL8CO15255 209 aa6.63□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 Q6JHZ5 121 aa6.63□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 ATRQ13535 2644 aa6.63□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.62□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 C16orf90A8MZG2 172 aa6.62□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 IGLV6-57P01721 117 aa6.62□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00846Q9NV44 126 aa6.62□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 APLNQ9ULZ1 77 aa6.62□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.61□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 A0A087WVE0 104 aa6.61□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.61□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 APCP25054 2843 aa6.6□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.59□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.59□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.59□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 IMUPQ9GZP8 106 aa6.59□□□□□ -1.35
TTPAL-202ENST00000372904 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.4 ms