RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
HDGFL3-201ENST00000299633 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.04□□□□□ -1.12
HDGFL3-201ENST00000299633 ODF3BA8MYP8 253 aa8.04□□□□□ -1.12
HDGFL3-201ENST00000299633 APLNQ9ULZ1 77 aa8.04□□□□□ -1.12
HDGFL3-201ENST00000299633 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.03□□□□□ -1.12
HDGFL3-201ENST00000299633 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.03□□□□□ -1.12
HDGFL3-201ENST00000299633 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.03□□□□□ -1.12
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.03□□□□□ -1.12
HDGFL3-201ENST00000299633 IGIPA6NJ69 53 aa8.03□□□□□ -1.12
HDGFL3-201ENST00000299633 NOTCH1P46531 2555 aa8.02□□□□□ -1.12
HDGFL3-201ENST00000299633 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.02□□□□□ -1.12
HDGFL3-201ENST00000299633 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.02□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 PRR9Q5T870 116 aa8.02□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 J3QKU1 62 aa8.02□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 C19orf84I3L1E1 186 aa8.02□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 K7EQG2 157 aa8.02□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.02□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.02□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 COX6A2Q02221 97 aa8.01□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.01□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.01□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 PRR15Q8IV56 129 aa8.01□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa8□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 CNFNQ9BYD5 112 aa7.99□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.98□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 COA5Q86WW8 74 aa7.98□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.98□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 Q8NA96 180 aa7.97□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 C6orf223Q8N319 242 aa7.97□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 A8MTW9 85 aa7.97□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 LY6G6CO95867 125 aa7.97□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.97□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF580Q9UK33 172 aa7.97□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 KLLNB2CW77 178 aa7.97□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.97□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 EPM2AB3EWF7 344 aa7.96□□□□□ -1.13
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.96□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 A8MUN3 132 aa7.95□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1B0GW54 56 aa7.95□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.95□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.94□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 COL6A5A8TX70 2615 aa7.94□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 DSPP15924 2871 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A0A0MQY5 61 aa7.94□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 FHL2Q14192 279 aa7.94□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.94□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC00313P59037 77 aa7.93□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A096LNJ9 63 aa7.93□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 MOBPQ13875 183 aa7.93□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.92□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 KIAA0087Q14695 138 aa7.92□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.92□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 Q8N2B8 174 aa7.92□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 LMO4P61968 165 aa7.92□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 ITPR3Q14573 2671 aa7.91□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.91□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 AMELXQ99217 191 aa7.9□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 PRO0461Q9UI25 63 aa7.9□□□□□ -1.14
HDGFL3-201ENST00000299633 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
HDGFL3-201ENST00000299633 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.89□□□□□ -1.15
HDGFL3-201ENST00000299633 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7.89□□□□□ -1.15
HDGFL3-201ENST00000299633 Q6ZQT0 140 aa7.89□□□□□ -1.15
HDGFL3-201ENST00000299633 Q6YL49 198 aa7.88□□□□□ -1.15
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC00483Q53H64 154 aa7.86□□□□□ -1.15
HDGFL3-201ENST00000299633 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.86□□□□□ -1.15
HDGFL3-201ENST00000299633 PRO3102Q9H379 93 aa7.86□□□□□ -1.15
HDGFL3-201ENST00000299633 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.86□□□□□ -1.15
HDGFL3-201ENST00000299633 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A1B0GUV1 79 aa7.85□□□□□ -1.15
HDGFL3-201ENST00000299633 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.85□□□□□ -1.15
HDGFL3-201ENST00000299633 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.84□□□□□ -1.15
HDGFL3-201ENST00000299633 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.84□□□□□ -1.15
HDGFL3-201ENST00000299633 WIPF1O43516 503 aa7.84□□□□□ -1.15
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC01006Q8NI28 216 aa7.83□□□□□ -1.16
HDGFL3-201ENST00000299633 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.83□□□□□ -1.16
HDGFL3-201ENST00000299633 Q1T7F1 81 aa7.83□□□□□ -1.16
HDGFL3-201ENST00000299633 CHD9Q3L8U1 2897 aa7.82□□□□□ -1.16
HDGFL3-201ENST00000299633 PCNTO95613 3336 aa7.82□□□□□ -1.16
HDGFL3-201ENST00000299633 Q8NBF4 154 aa7.82□□□□□ -1.16
HDGFL3-201ENST00000299633 A8MWP4 228 aa7.82□□□□□ -1.16
HDGFL3-201ENST00000299633 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.82□□□□□ -1.16
HDGFL3-201ENST00000299633 FHL3Q13643 280 aa7.81□□□□□ -1.16
HDGFL3-201ENST00000299633 APCP25054 2843 aa7.81□□□□□ -1.16
HDGFL3-201ENST00000299633 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.81□□□□□ -1.16
HDGFL3-201ENST00000299633 AVPP01185 164 aa7.8□□□□□ -1.16
HDGFL3-201ENST00000299633 C5orf42Q9H799 3197 aa7.8□□□□□ -1.16
HDGFL3-201ENST00000299633 C22orf24Q9Y442 160 aa7.78□□□□□ -1.16
HDGFL3-201ENST00000299633 Q96NJ1 140 aa7.78□□□□□ -1.16
HDGFL3-201ENST00000299633 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.78□□□□□ -1.16
HDGFL3-201ENST00000299633 ITPR2Q14571 2701 aa7.78□□□□□ -1.16
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM229AH3BQW9 127 aa7.78□□□□□ -1.16
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms